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文檔簡(jiǎn)介
1、目的:
1.繪制浙江省臺(tái)州地區(qū)非綜合征型耳聾患者線粒體12S rRNA和GJB2基因變異頻譜,完善臺(tái)州地區(qū)耳聾患者致病基因和變異位點(diǎn)的數(shù)據(jù)庫(kù)。
2.進(jìn)一步闡明攜帶線粒體12S rRNAA1555G的耳聾患者可能的高外顯率的發(fā)病機(jī)制。
3.探討GJB2基因各變異類型特點(diǎn)及其對(duì)應(yīng)耳聾表型特點(diǎn),提供GJB2基因變異分子診斷方法,為GJB2基因診斷提供依據(jù)。
4.初步制定線粒體12S rR
2、NA和GJB2基因耳聾遺傳咨詢程序、內(nèi)容和方式。
方法:
1.收集臺(tái)州地區(qū)助聽(tīng)器配置耳聾患者、溫嶺市聾啞學(xué)校患兒和溫嶺市第一人民醫(yī)院耳鼻喉科門診非綜合征型耳聾患者共173例血樣,并采集患者臨床資料,進(jìn)行統(tǒng)一整理。
2.提取173例耳聾患者的血樣基因組DNA,進(jìn)行線粒體12S rRNA和GJB2基因聚合酶鏈反應(yīng)(polymerise chain reaction,PCR)擴(kuò)增,產(chǎn)物純化后測(cè)序。使用
3、生物軟件如DNAStar和Chromas2.0等將測(cè)序結(jié)果與線粒體和GJB2的標(biāo)準(zhǔn)參考序列進(jìn)行比對(duì)分析,查找線粒體基因組和GJB2變異位點(diǎn),統(tǒng)計(jì)這兩個(gè)基因患者的變異位點(diǎn)和樣本數(shù)目,并繪制臺(tái)州地區(qū)耳聾患者這兩個(gè)基因的變異頻譜。
3.將篩查到的攜帶線粒體12S rRNAA1555G變異的耳聾患者進(jìn)行線粒體基因組的擴(kuò)增和測(cè)序,根據(jù)測(cè)序結(jié)果分析線粒體單體型,結(jié)合臨床資料進(jìn)一步分析單體型對(duì)耳聾表型表達(dá)的影響,以及是否存在其他線粒體上
4、的繼發(fā)突變對(duì)耳聾表型表達(dá)的影響。
4.分析臺(tái)州地區(qū)耳聾患者GJB2基因耳聾相關(guān)致病性變異位點(diǎn)的類型特點(diǎn)及其對(duì)應(yīng)耳聾表型表達(dá)特點(diǎn)。
5.對(duì)篩查到的攜帶線粒體12S rRNA和GJB2基因上耳聾相關(guān)變異位點(diǎn)的耳聾患者進(jìn)行遺傳學(xué)分析,包括遺傳方式及遺傳規(guī)律等,并進(jìn)一步總結(jié)及初步制定遺傳咨詢的程序和內(nèi)容。
結(jié)果:
1.成功收集浙江省臺(tái)州地區(qū)助聽(tīng)器配置耳聾患者、溫嶺市聾啞學(xué)校患兒和溫嶺市第一
5、人民醫(yī)院耳鼻喉科門診耳聾患者共173例血樣。
2.成功繪制臺(tái)州地區(qū)耳聾患者線粒體12S rRNA和GJB2基因上變異頻譜。
3.173例臺(tái)州地區(qū)的非綜合征型耳聾患者中攜帶線粒體12S rRNAA1555G變異患者有6例,占耳聾患者的3.47%。結(jié)合線粒體全基因組的測(cè)序結(jié)果這6例患者的分別是線粒體東亞單體型A4、B4a2、B5b1、D4b2b2、F1a和F3a,另外,發(fā)現(xiàn)有2例患者除攜帶A1555G變異外分別攜
6、帶線粒體tRNAThr上的T15943C和A15924G變異。
4.173例臺(tái)州地區(qū)的耳聾患GJB2基因上發(fā)現(xiàn)GJB2基因序列改變達(dá)到73.41%;其中致病變異耳聾相關(guān)患者43例,占耳聾患者的24.86%,最常見(jiàn)的235delC變異率達(dá)到21.97%。
5.分析線粒體12S rRNA和GJB2基因耳聾相關(guān)的致病變異位點(diǎn)遺傳特征,并初步制定屬于本實(shí)驗(yàn)室和Attardi線粒體生物醫(yī)學(xué)研究院的主要以這兩個(gè)基因?yàn)橹鞯?/p>
7、耳聾遺傳咨詢程序、內(nèi)容和方式。
結(jié)論:
1.發(fā)現(xiàn)6例攜帶線粒體12S rRNAA1555G變異患者,占173例臺(tái)州地區(qū)耳聾患者的3.47%。線粒體單體型對(duì)A1555G變異患者的耳聾表型表達(dá)可能影響不大。線粒體tRNAThr上的T15943C和A15924G變異可能是影響線粒體A1555G變異耳聾患者表型表達(dá)的新的繼發(fā)突變位點(diǎn)。
2.臺(tái)州地區(qū)非綜合征型耳聾患者GJB2基因變異占73.41%,致病變
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