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文檔簡(jiǎn)介
1、目的:
探討心臟發(fā)育相關(guān)基因胰島因子1(Islet1,ISL1)SNP位點(diǎn)(rs41268421、rs1017)與先天性心臟?。–ongenital Heart Disease,CHD)的相關(guān)性,為闡明CHD的發(fā)生機(jī)制并進(jìn)行遺傳學(xué)干預(yù)提供理論依據(jù),為其他先天畸形的研究提供科學(xué)的方法。
方法:
1利用NCBI網(wǎng)站SNPs數(shù)據(jù)庫查找ISL1基因內(nèi)部和周圍所有SNPs,同時(shí)參考相關(guān)文獻(xiàn),確定所要研究的SNPs位點(diǎn)
2、。
2采用病例-對(duì)照研究方法,選取2011年12月至2012年12月在天津市兒童醫(yī)院心內(nèi)科住院接受治療的35名CHD患兒納入本研究,其中男孩18例,女孩17例,男女之比為1.06∶1,年齡7月至3歲,平均年齡23±6月。患兒均符合CHD的診斷標(biāo)準(zhǔn),具有典型的臨床癥狀,并經(jīng)心臟彩色超聲、心導(dǎo)管或手術(shù)證實(shí),其中室間隔缺損類型患兒18例,房間隔缺損類型患兒17例。來自我院同期外科收治的除外CHD的30名兒童作為對(duì)照組,其中男孩15例
3、,女孩15例,男女之比為1∶1,年齡6月至3歲,平均年齡22±9月,經(jīng)心臟彩色超聲明確未患有CHD。采集所有研究對(duì)象的外周靜脈血2ml,枸櫞酸鈉抗凝,于-80℃保存?zhèn)溆谩?br> 3基因測(cè)序并評(píng)價(jià)SNP位點(diǎn)和CHD的相關(guān)性。從血液中提取DNA,應(yīng)用聚合酶鏈反應(yīng)(PCR)聯(lián)合直接基因測(cè)序技術(shù)對(duì)研究對(duì)象的ISL1基因SNPrs41268421、rs1017多態(tài)性進(jìn)行檢測(cè)。分別比較兩個(gè)SNP位點(diǎn)基因型頻率和等位基因頻率在兩組的分布情況,并進(jìn)
4、行單體型分析。
結(jié)果:
1 ISL1基因SNP位點(diǎn)rs41268421存在GG、GT、TT3種基因型,CHD組攜帶T等位基因的基因型(包括GT和TT)頻率與對(duì)照組相比具有明顯的差異,差異顯著(x2=4.169,P<0.05),并且CHD組攜帶T等位基因的基因型頻率高于對(duì)照組。攜帶T等位基因的兒童患CHD的危險(xiǎn)是G等位基因的4.833倍。
2 ISL1基因SNP位點(diǎn)rs1017存在AA、AT、TT3種基因型,
5、CHD組攜帶T等位基因的基因型(包括AT和TT)頻率與對(duì)照組相比具有明顯的差異,差異顯著(x2=6.807,P<0.01),并且CHD組攜帶T等位基因的基因型頻率高于對(duì)照組。攜帶T等位基因的兒童患CHD的危險(xiǎn)是A等位基因的4.491倍。
3對(duì)ISL1基因SNPrs41268421、rs1017這兩個(gè)位點(diǎn)單體型進(jìn)行分析,共檢出4種單體型,分別是GA、GT、TA、TT,其中表現(xiàn)TT單體型的兒童患CHD的危險(xiǎn)度最高(OR=7.813
6、)。
結(jié)論:
1 ISL1基因SNP rs41268421、rs1017位點(diǎn)多態(tài)性可能與中國漢族兒童CHD易感性相關(guān)。
2 ISL1基因SNPrs41268421位點(diǎn)等位基因T可能為中國漢族兒童患CHD的危險(xiǎn)因素。
3 ISL1基因SNPrs1017位點(diǎn)等位基因T可能增加中國漢族患兒童患CHD的危險(xiǎn)性。
4對(duì)ISL1基因SNPrs41268421、rs1017兩位點(diǎn)進(jìn)行單體型分析,得出在
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