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文檔簡介
1、1、在蛋白提取、雙向電泳上樣量和等電聚焦程序方面對適于大豆葉片蛋白質(zhì)組學(xué)研究的雙向電泳技術(shù)進行了改進:改進的TCA/丙酮法能促進蛋白質(zhì)復(fù)溶;蛋白上樣量增加至450μg可使低峰度蛋白得到更好的顯現(xiàn);在等電聚焦程序中采用10小時低電壓除鹽可獲得更佳的聚焦效果。改進后的方法獲得的栽培和野生大豆葉片蛋白質(zhì)雙向電泳圖譜重復(fù)性好,經(jīng)ImageMaster軟件匹配,同組樣品組內(nèi)匹配率超過80%;不同樣品電泳圖譜可比性高,組間匹配率接近或超過80%。
2、 2、以改進后的方法對栽培和野生大豆葉片(各17個品種的葉片混合制成樣品)進行雙向電泳實驗。電泳圖譜利用ImageMaster軟件分析,每張凝膠上平均找到668個置信蛋白質(zhì)點,對所有匹配蛋白質(zhì)點按Ratio值>1.5篩選,同時進行T檢驗分析(p<0.05)尋找顯著差異的蛋白質(zhì):絕大多數(shù)蛋白無顯著差異,占栽培和野生組可匹配蛋白質(zhì)點總數(shù)的96.55%;在栽培和野生組間共找到了23個差異顯著的蛋白質(zhì)點,占總數(shù)的3.45%。其中,栽培表達
3、量上調(diào)的點有12個,下調(diào)的點11個,分別占總數(shù)的1.80%和1.65%。另外,通過ImageMaster軟件和人工肉眼分析比對,未能在栽培或野生群體中發(fā)現(xiàn)群體特有的蛋白。我們推論,馴化帶來的差異體現(xiàn)在少數(shù)蛋白質(zhì)表達量的變化上。 3、選取10個主要的差異蛋白質(zhì)點進行單級質(zhì)譜分析(MALDI-TOF-MS),均打出高質(zhì)量的峰圖,用Mascot檢索程序?qū)CBInr蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫進行全庫搜索,均獲得了相關(guān)蛋白或同源蛋白陽性報告(p<0.
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