中國漢族人群腦膠質(zhì)瘤遺傳易感性研究——歐洲人群GWAS結果的驗證和精細定位.pdf

1、復旦大學博士學位論文中國漢族人群腦膠質(zhì)瘤遺傳易感性研究歐洲人群GWAS結果的驗證和精細定位姓名：范薇薇申請學位級別：博士專業(yè)：遺傳學指導教師：盧大儒20110415第二部分中國漢族人群腦膠質(zhì)瘤易感區(qū)域精細定位研究精細定位是通過增加易感區(qū)域內(nèi)遺傳標記的檢測密度，找到與疾病關聯(lián)程度最強的一組變異，進而確定易感基因或者縮小易感區(qū)域和更好地理解疾病通路。國外已經(jīng)有人應用精細定位在前列腺癌的易感性分析，并獲得了一些新的疾病相關位點?；谖覀冊谥袊?/p>

2、漢族人群中驗證14個與腦膠質(zhì)瘤患病風險強烈相關的單核苷酸多態(tài)(Singlenucleotidepolymorphism，SNP)位點，發(fā)現(xiàn)分別位于20q1333，1lq233和5p1533這三個染色體區(qū)域的5個SNP在中國漢族人群中與腦膠質(zhì)瘤患病風險強烈相關，且這三個染色體區(qū)域可能是中國人群腦膠質(zhì)瘤患病風險的易感區(qū)域。我們從染色體區(qū)域20q1333，1lq233和5p1533臨近以上三個風險SNP分別約86kb，96kb矛D15lkb的

3、區(qū)域，基于HAPMAP亞洲人群數(shù)據(jù)利用連鎖不平衡規(guī)律選取了43個標簽SNP位點，在中國漢族人群983例腦膠質(zhì)瘤病例和1024侈U健康對照中進行精細定位研究。我們的研究結果在中國漢族人群中新發(fā)現(xiàn)了13個SNP位點的等位基因分布頻率與腦膠質(zhì)瘤患病風險強烈相關，分別為RTELl區(qū)(20q1333)9個位點rs6089953，rs6062484，rs3787098，rs2297440，rs2257885，rs3761121，rsl058319，

4、rs5019252，rs6011076，P值為902E05，216E一05，402E04，511E06，140E09，445E07，129E一11，431E08，688E一35；和PHLDBl(1lq2313)4個位點rs7115634，rs2236661，rs494560，rsl7748，P值為285E04，181E05，432E05，287E05。根據(jù)43個SNP在983例對照樣本中的分型數(shù)據(jù)所得到的位點之間連鎖不平衡程度，TERT

5、區(qū)(20q1333)的3個SNP(rs4635969，rs401681和rs414965)，RTELl區(qū)(20q1333)6個SNP(rs6089953和rs2738780；rs6062484和rs2297437；rs5019252和rs4809224)及基因PHLDBl區(qū)(1lq233)8個SNP(rsl2289253和rs3741324；rs494560署Hrsl7748；rsl0892251和rsll216943；rs463996