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文檔簡(jiǎn)介
1、目的:檢測(cè)人類子宮內(nèi)膜著床窗口期miRNA表達(dá)譜,建立miRNA 參與調(diào)控胚胎著床的生物信息網(wǎng)絡(luò)。
方法:雙通道微陣列技術(shù)檢測(cè)人類子宮內(nèi)膜著床窗口期miRNA表達(dá)譜,應(yīng)用MMIA在線服務(wù)器進(jìn)行靶mRNA基因預(yù)測(cè),用Cytoscape 軟件構(gòu)建由miRNAs和mRNAs組成的生物信息網(wǎng)絡(luò),通過(guò)MAS在線服務(wù)器對(duì)生物信息網(wǎng)絡(luò)中差異表達(dá)mRNAs基因進(jìn)行功能分類,預(yù)測(cè)miRNA 參與調(diào)控胚胎著床的關(guān)鍵分子通路。
結(jié)
2、果:
1.著床窗口期有72個(gè)miRNAs 差異表達(dá),其中50個(gè)顯著上調(diào),22個(gè)顯著下調(diào)(fold change=2,q value<0.01);
2.除去23 種miRNAs 未能預(yù)測(cè)到靶基因外,余下49 種miRNAs 預(yù)測(cè)到6106 種擁有唯一官方基因符號(hào)的靶mRNAs基因。對(duì)于每個(gè)差異表達(dá)的miRNA 來(lái)說(shuō),預(yù)測(cè)mRNAs 靶基因的數(shù)量存在較大差異;
3.篩選出著床窗口期差異表達(dá)的miRN
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