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1、我們完成的主要工作如下:(1)編程實(shí)現(xiàn)簡(jiǎn)化的環(huán)匹配算法、 Mfold算法和Lyngsφ算法,給出其試驗(yàn)與比較結(jié)果. (2)提出一個(gè)實(shí)用的新簡(jiǎn)化模型和相應(yīng)的動(dòng)態(tài)規(guī)劃算法1.模型僅引入一種缺口矩陣whx來包含多個(gè)堆迭、嵌套和交叉?zhèn)谓Y(jié)點(diǎn),相對(duì)Rivas模型的4種缺口矩陣簡(jiǎn)化了存儲(chǔ)結(jié)構(gòu)和空間.算法利用構(gòu)成準(zhǔn)堆迭結(jié)構(gòu)的兩段序列的核甘酸數(shù)之差小于常數(shù)U這一特性,并使用Lynsφ中算法的一個(gè)計(jì)算技巧降低了時(shí)間復(fù)雜度,其時(shí)間復(fù)雜度為O(n<'5>),空
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