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文檔簡介
1、黃酮類化合物是一類廣泛存在于植物中的次生代謝產(chǎn)物,對于植物的自身防御和生理調(diào)節(jié)具有重要的作用。黃酮類化合物還具有抗氧化、抑菌消炎、抑制腫瘤細胞活性、抗HIV活性等功能,且毒性較小,藥用價值較高。種子植物中黃酮代謝途徑已研究的較為透徹,作為黃酮含量較高的蕨類植物,其黃酮代謝途徑尚不清楚。查爾酮異構(gòu)酶(CHI)是黃酮代謝途徑的關(guān)鍵限速酶之一,其主要功能為催化柚皮素查爾酮轉(zhuǎn)化為柚皮素,生成的柚皮素是后續(xù)多條代謝通路的前體物質(zhì),種子植物中的CH
2、I基因?qū)儆诓闋柾悩?gòu)酶基因家族,分為TypeΙ、TypeⅡ、TypeⅢ、TypeⅣ四個類型,具有不同的生物學(xué)功能。然而,蕨類植物中CHI基因的結(jié)構(gòu)特征、類型及其功能尚不清楚,研究蕨類植物中CHI基因,對闡明黃酮代謝途徑的分子機制,揭示CHI基因的功能及其演化均具有重要的科學(xué)意義。
本研究以紅蓋鱗毛蕨為實驗材料,應(yīng)用轉(zhuǎn)錄組測序、PCR及高效液相色譜技術(shù)對查爾酮異構(gòu)酶基因(CHI)進行克隆及表達分析,并對該基因序列的結(jié)構(gòu)及蛋白結(jié)構(gòu)
3、和蛋白功能等方面做了生物信息學(xué)分析。本研究的實驗結(jié)果主要有以下幾個方面:
1.利用Ilumina Hiseq2000平臺對紅蓋鱗毛蕨拳卷葉進行測序,獲得8.5G數(shù)據(jù)量。對獲得的數(shù)據(jù)進行組裝拼接,共獲得Unigene143604條。依據(jù)注釋結(jié)果分析獲得CHI可能性基因6條,經(jīng)分析選取其中3條作為CHI的候選基因。
2.利用轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù),成功克隆到三條基因的ORF序列,將三條基因序列重新命名為:DeCHI1、DeCHI
4、2和DeCHI3。生物信息學(xué)分析表明,DeCHI1的ORF全長651bp,編碼216個氨基酸;DeCHI2的ORF全長822bp,編碼273個氨基酸;DeCHI3的ORF全長738bp,編碼245個氨基酸。聚類分析表明, DeCHI1與TypeΙ和TypeⅡ呈并列關(guān)系;DeCHI2屬于Type IV型;DeCHI3屬于Type III型。
3.本研究成功構(gòu)建3條CHI的重組質(zhì)粒pET32a-DeCHI1、pET32a-DeCH
5、I2、pET32a-DeCHI3,將重組質(zhì)粒導(dǎo)入到BL21感受態(tài)細胞中構(gòu)建原核表達載體,并用IPTG誘導(dǎo)獲得融合蛋白,經(jīng)SDS-PAGE鑒定獲得蛋白大小分別為39.7kDa、45.0kDa、43.1kDa,與預(yù)期的蛋白大小相一致。
4.本研究以柚皮素查爾酮和異甘草素為底物,分別采用3條基因純化后的融合蛋白對底物進行催化,催化產(chǎn)物上高效液相色譜(HPLC)檢測,檢測結(jié)果表明:①DeCHI1、DeCHI2和DeCHI3的蛋白酶均能
6、催化柚皮素查爾酮轉(zhuǎn)化為柚皮素,同時也能催化異甘草素轉(zhuǎn)化為甘草素,與目前報道的種子植物Type III CHI和Type IV CHI蛋白酶沒有催化活性不同;②DeCHI1不僅能催化柚皮素查爾酮,還能催化異甘草素轉(zhuǎn)化為甘草素,與現(xiàn)有報道僅豆科植物TypeⅡ可催化異甘草素的結(jié)論不同,進化樹聚類分析結(jié)果顯示DeCHI1與種子植物的TypeⅠ和TypeⅡ在同一簇中,推測其具有TypeⅠ和TypeⅡ的功能,推測結(jié)果與實驗結(jié)果相符;③在DeCHI1
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