不同地區(qū)自然發(fā)酵乳中乳酸乳球菌多位點(diǎn)序列分型研究.pdf

1、本研究以分離自內(nèi)蒙古赤峰市、巴彥淖爾市、呼倫貝爾市、錫林郭勒盟和鄂爾多斯市，西藏自治區(qū)、青海省、云南省、四川省、甘肅省和蒙古國的204株乳酸乳球菌為研究對象，應(yīng)用多位點(diǎn)序列分型技術(shù)，通過雙向測序技術(shù)獲得dnaA、pyrG、rpoB、groEL、recA、clpX、carB、murC、pepN、pepX、murE和pheS12個(gè)持家基因的序列，將其拼接、核對后用BioNumerics v6.0構(gòu)建等位基因圖譜并確立序列型(STs)，進(jìn)而對

2、204株乳酸乳球菌進(jìn)行分型，系統(tǒng)分析菌株間的系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化關(guān)系。結(jié)果表明：
　　(1)204株乳酸乳球菌共分為75個(gè)STs，分離自相同地區(qū)的乳酸乳球菌分離株大多有著相同的STs。75個(gè)STs經(jīng)過eBURST分析后，共形成13個(gè)分型組，28個(gè)獨(dú)特型。13個(gè)分型組中有7個(gè)克隆復(fù)合體。其中CC26包含乳酸乳球菌分離株最多，被認(rèn)為是較為原始的CC。
　　(2)通過最小生成樹分析，結(jié)果表明204株乳酸乳球菌之間的進(jìn)化關(guān)系，大部分與分離地

3、之間的距離遠(yuǎn)近呈現(xiàn)正相關(guān)性，分離自不同地區(qū)的菌株可能大部分是由分離自赤峰市的菌株進(jìn)化而來。另外最小生成樹分析還發(fā)現(xiàn)了兩株被16SrDNA序列分析方法鑒定為Lactococcus lactis subsp. lactis的菌株親緣關(guān)系與Lactococcus lactis subsp. cremoris更近。
　　(3)系統(tǒng)發(fā)育分析結(jié)果表明，分離自相同地區(qū)發(fā)酵乳中的乳酸乳球菌的STs大部分聚集在同一類群。分離自內(nèi)蒙古赤峰市的菌株群體

4、分化時(shí)間較長，說明分離自不同地區(qū)的204株乳酸乳球菌可能由同一祖先進(jìn)化而來，而這一祖先菌株可能來源于內(nèi)蒙古赤峰市。
　　本研究對不同地區(qū)的204株乳酸乳球菌進(jìn)行多位點(diǎn)序列分型研究，初步建立了一種新的乳酸乳球菌的分型方法，為乳酸乳球菌的MLST數(shù)據(jù)庫提供了豐富的數(shù)據(jù)資料。通過比較各個(gè)菌株等位基因序列的差異，初步了解菌株基因序列的進(jìn)化關(guān)系，并分析不同地區(qū)的乳酸乳球菌的遺傳背景，從而推演乳酸乳球菌的進(jìn)化歷程，為世界范圍內(nèi)乳酸乳球菌的群體