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文檔簡介
1、目的:胃癌是我國最常見的惡性腫瘤之一。本研究旨在尋找胃癌微環(huán)境中差異蛋白質(zhì)分子,并探討其表達調(diào)控的機制,揭示微環(huán)境在胃癌發(fā)生發(fā)展過程中的作用。
方法:
1.采用激光捕獲顯微切割(LCM)技術(shù),分別切取新鮮正常胃粘膜組織(NGM)和胃腺癌組織(GAC)中間質(zhì),獲取高純度的NGM和GAC間質(zhì)總蛋白質(zhì),同位素標(biāo)記(iTRAQ),結(jié)合二維液相色譜聯(lián)用質(zhì)譜(2D LC-MS/MS)技術(shù),鑒定NGM和GAC間微環(huán)境中的差異表達蛋
2、白質(zhì)分子。通過生物信息學(xué)方法,分析胃癌微環(huán)境蛋白質(zhì)分子間的相互作用。選取胃癌間質(zhì)中高表達蛋白質(zhì)(FN1和MCL1)和低表達蛋白質(zhì)(EMILIN1和COL1A1),運用Western blot和免疫組織化學(xué)染色方法,驗證NGM及GAC組織中蛋白質(zhì)組學(xué)實驗結(jié)果,分析GAC間質(zhì)差異表達蛋白質(zhì)分子的臨床病理學(xué)意義。
2.蛋白質(zhì)組學(xué)實驗結(jié)果,經(jīng)生物信息軟件分析,篩尋調(diào)控GAC間質(zhì)差異蛋白質(zhì)分子表達的miRNAs。選取其中的miR-125
3、b進行研究,采用qRT-PCR和原位雜交技術(shù),檢測miR-125b在NGM和GAC組織中的表達,分析miR-125b表達與胃癌患者臨床病理及預(yù)后的關(guān)系;將miR-125b轉(zhuǎn)染于胃癌MGC-803細(xì)胞,通過細(xì)胞生長曲線繪制、Transwell侵襲、流式細(xì)胞儀、Western blot及裸鼠成瘤,分析miR-125b導(dǎo)入MGC-803細(xì)胞,對MGC-803細(xì)胞生長增殖、凋亡及侵襲的影響。Targetscan6.2軟件分析,預(yù)測miR-125
4、b可能參與調(diào)控胃癌的靶基因;采用熒光素酶基因報告檢測、qRT-PCR與Western blot方法,證實MCL1基因為miR-125b調(diào)控的靶基因;免疫組織化學(xué)染色,觀察注射miR-125b,荷瘤組織中MCL1表達水平;構(gòu)建MCL1 干擾載體,采用生長曲線繪制、Transwell侵襲實驗、流式細(xì)胞
儀與Western blot,觀察敲低MCL1基因表達,對MGC-803細(xì)胞增殖、凋亡及侵襲能力的影響。
結(jié)果
5、:
1.本研究在胃癌間質(zhì)中總共鑒定出差異蛋白質(zhì)分子123個,其中表達上調(diào)56個,下調(diào)67個,這些蛋白質(zhì)涉及腫瘤相關(guān)的信號通路(如MAPK信號通路、VEF信號通路、p53信號通路等)、器官發(fā)育、細(xì)胞生長、增殖、凋亡、代謝、激應(yīng)、運輸及免疫等;部分蛋白質(zhì)在STRING網(wǎng)絡(luò)中呈現(xiàn)相互節(jié)點,兩兩間相互聯(lián)系;免疫組織化學(xué)染色結(jié)果顯示,EMILIN1和COL1A1蛋白質(zhì)在胃癌組織中低表達,而MCL1和FN1蛋白質(zhì)則在胃癌組織中高表達。MC
6、L1和FN1在胃癌中高表達,與胃癌分化程度、腫塊大小、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移及TNM分期呈正相關(guān),與EMILIN1和COL1A1表達則呈負(fù)相關(guān)(P<0.01)。
2.通過生物信息學(xué)軟件,預(yù)測調(diào)控胃癌微環(huán)境差異蛋白質(zhì)分子的micRNAs,分析顯示miR-125b調(diào)控多個蛋白質(zhì);miR-125b在胃癌組織中低表達,其表達與胃癌組織的分化程度呈正相關(guān)(P<0.01);miR-125b在TNM分期I-II期患者的陽性表達率高于III-IV期患者,
7、與胃癌患者TNM分期呈負(fù)相關(guān)(P<0.01);miR-125b表達與胃癌淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移呈負(fù)相關(guān)( P<0.01);Kaplan-meier生存曲線分析顯示,miR-125b表達胃癌患者生存期相關(guān),miR-125b高表達患者生存期長于miR-125b低表達組,miR-125b表達低,患者預(yù)后差(P<0.01)。
3.miR-125b導(dǎo)入MGC-803細(xì)胞,細(xì)胞生長速度減慢,侵襲能力降低,細(xì)胞凋亡率增加,Cleaved caspase
8、-3及Cleaved PARP表達增加(P<0.01),裸鼠荷瘤體積變小、重量減輕(P<0.01);MCL1是miR-125b的靶基因,核苷酸結(jié)合位點是 MCL1基因3’UTR的2613-2620;miR-125b高表達,MGC-803細(xì)胞 MCL1基因表達降低(P<0.01);敲低MCL1基因在MGC-803細(xì)胞的表達,細(xì)胞生長速度減慢,侵襲能力降低,細(xì)胞凋亡增加,Cleaved caspase-3及Cleaved PARP表達增加(
9、P<0.01);注射miR-125b,可抑制裸鼠荷瘤生長,荷瘤組織內(nèi)MCL1蛋白質(zhì)的表達降低(P<0.01)。
結(jié)論:
1.篩選胃癌微環(huán)境差異表達蛋白質(zhì)123個,其中上調(diào)56個,下調(diào)67個。
2.miR-125b在胃癌組織中低表達,其表達水平與胃癌分化程度、TNM分期、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移及患者預(yù)后相關(guān)。
3.miR-125b可抑制MCL1基因表達,活化Caspase-3信號通路,降低MGC803細(xì)胞增殖與
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