基因和蛋白質(zhì)的批量注釋系統(tǒng)UBROAD.pdf_第1頁
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1、上海大學碩士學位論文基因和蛋白質(zhì)的批量注釋系統(tǒng)UBROAD姓名：張祥云申請學位級別：碩士專業(yè)：生物化工指導教師：郭景康20060501上海大學碩士學位論文ABSTRACTHighthroughputexperiments1ikemicroarrayorproteinmassspectrometrycanproducehugeamountofdataefficientlyThesedata，aftersomekindofbasicprep

2、rocessing，areoftenpresentedintheformofalistofgene／proteinidentifiersaccompaniedwith(semi)quantitativeexperimentaldatasuchasexpressionprofilesItisnecessarytoobtaindetailedannotationinformationaboutthesegenes／proteinstofur

3、theranalyzethesedataandtoextractbiologicalmeaningsfromthesedataWedevelopedawebbasedsoftwareUBROAD(UnifiedBatchRetrieverOfAnnotationData)tofacilitatethequickandefficientretrievalofannotationdataforgenesandproteinsfromvari

4、oussourcesUBROADintegratedseveralbiologicaldatasourcesincludingSwiss—Prot，NcBIandBIND，andsupportmixedsearchesofseventypesofidentifiersincludingUniprot／trEMBLAC，UniprotEntryname，GenbankProteinAccessionNumber，GenbankmRNAgi

5、，GenbankmRNAAccessionNumber，GenenameandGeneIDTheoutputfileincludes38annotationitemsthatcanbedownloadedintheformofMicrosoft@OfficeExcelUBRoADisfreelyavailablebyvisitingoursite：http：／／刑bioscienceorgcn／UBROADKeywords：Bioinf

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