克雷伯桿菌質粒耐藥性研究.pdf

1、目的： 本文研究作為本研究所研究課題的一部分，主要研究了臨床上常見也是很重要的致病菌肺炎克雷伯菌的耐藥質粒。細菌耐藥性的改變，往往與細菌所攜帶的耐藥基因有關，而這些基因往往位于耐藥菌所攜帶的質粒上，可通過質?；蛸|粒所攜帶的可移動元件在細菌群體中播散。因此，我們通過對質粒DNA序列的測定，分析質粒所攜帶的功能基因，從基因組水平研究肺炎克雷伯菌質粒DNA的結構，質粒與宿主菌的耐藥性和致病性等的關系，為進一步分析肺炎克雷伯菌質粒DNA

2、結構的演變規(guī)律和分子進化，以及肺炎克雷伯菌的耐藥性和致病性機理的研究打下基礎。 方法： 本課題從溫州醫(yī)學院附屬第一醫(yī)院臨床得到206株肺炎克雷伯菌作為本實驗菌株來源。采用堿裂解法提取質粒DNA，將全部質粒DNA送交深圳華大基因組科學研究院進行solexa測序，再用SOAP軟件對我們關心的耐藥基因進行分析，得到分析結果的序列。通過BLAST比對我們關心的基因，通過生物信息的方法，研究所測肺炎克雷伯菌所有質粒包含ESBLs的

3、SNP情況，從而得到不同位點的突變率和新的亞型。對于拼接好的序列，通過BLAST比對蛋白數(shù)據庫（NCBI庫）和COGs，確定蛋白家族。進一步對這些基因進行功能分析，并在基因組水平上研究肺炎克雷伯菌質粒耐藥性的傳播、演變規(guī)律及分子進化機制。 結論： 以上研究表明： 1．在肺炎克雷伯桿菌的質粒中含有大量的耐藥基因。 2．所測數(shù)據中有大量與已知質粒相同的基因，尤其是耐藥基因與結合轉移基因，可以認為肺炎克雷伯菌的