應用生物信息學方法從低氧處理人動脈內(nèi)皮細胞SAGE庫中挖掘低氧反應相關新基因.pdf_第1頁
已閱讀1頁，還剩72頁未讀， 繼續(xù)免費閱讀

下載本文檔

版權(quán)說明：本文檔由用戶提供并上傳，收益歸屬內(nèi)容提供方，若內(nèi)容存在侵權(quán)，請進行舉報或認領

文檔簡介

1、低氧與許多生理和病理過程相關，目前我國死亡率前四名的心血管病、腦中風、腫瘤和呼吸系統(tǒng)疾病都直接或間接涉及機體低氧，研究生物體對低氧的反應機制具有重大意義。本研究利用生物信息學方法，從人大動脈內(nèi)皮細胞(humanaortic endothelial cells，HAECs)短期、持續(xù)低氧處理的SAGE庫中，挖掘與低氧反應相關的新基因；用3D-PSSM和CDD(Conserved Domain Database)等軟件預測新基因蛋白產(chǎn)物的功

2、能；從中選擇感興趣的候選基因，對其進行進一步的生物信息學分析，最終確定對2個基因進行克隆。結(jié)果如下： l、從人大動脈內(nèi)皮細胞(human aortic endothelial cells，HAECs)短期、持續(xù)低氧處理8h的SAGE庫中的40629個tags(12289 unique)中挖掘出998個與低氧反應相關的新基因。 2、用3D-PSSM和CDD等軟件從998個與低氧反應相關的新基因中預測到369個蛋白產(chǎn)物有

3、功能的新基因，根據(jù)功能將其分為14類，其中大部分與信號傳導、基因的表達調(diào)控、細胞骨架和翻譯后修飾有關。 3、選擇了8個感興趣的侯選基因，對其進行了進一步的生物信息學分析，最終選定了第1、4號2個基因進行克隆。 4、構(gòu)建了第1號基因的鼠源序列的真核表達載體(pcDNA3.1/Myc-His(-)AMCS)；構(gòu)建了第4號基因的人源和鼠源序列的真核表達載體fcDNA3.1/Myc-His(-)AMCS)，測序證明了序列的正確性

溫馨提示

  • 1. 本站所有資源如無特殊說明，都需要本地電腦安裝OFFICE2007和PDF閱讀器。圖紙軟件為CAD,CAXA,PROE,UG,SolidWorks等.壓縮文件請下載最新的WinRAR軟件解壓。
  • 2. 本站的文檔不包含任何第三方提供的附件圖紙等，如果需要附件，請聯(lián)系上傳者。文件的所有權(quán)益歸上傳用戶所有。
  • 3. 本站RAR壓縮包中若帶圖紙，網(wǎng)頁內(nèi)容里面會有圖紙預覽，若沒有圖紙預覽就沒有圖紙。
  • 4. 未經(jīng)權(quán)益所有人同意不得將文件中的內(nèi)容挪作商業(yè)或盈利用途。
  • 5. 眾賞文庫僅提供信息存儲空間，僅對用戶上傳內(nèi)容的表現(xiàn)方式做保護處理，對用戶上傳分享的文檔內(nèi)容本身不做任何修改或編輯，并不能對任何下載內(nèi)容負責。
  • 6. 下載文件中如有侵權(quán)或不適當內(nèi)容，請與我們聯(lián)系，我們立即糾正。
  • 7. 本站不保證下載資源的準確性、安全性和完整性, 同時也不承擔用戶因使用這些下載資源對自己和他人造成任何形式的傷害或損失。

評論

0/150

提交評論