細(xì)胞因子-受體相互作用的預(yù)測.pdf

1、細(xì)胞因子是由多種細(xì)胞所分泌的低分子量(15～30KD)的蛋白或糖蛋白，通過與相應(yīng)受體的結(jié)合，調(diào)節(jié)細(xì)胞的生長和分化，參與免疫、炎癥反應(yīng)和創(chuàng)傷愈合。因?yàn)榧?xì)胞因子通過與受體的相互作用來行使以上功能，所以細(xì)胞因子-受體相互作用成為研究細(xì)胞因子功能的關(guān)鍵。然而，由于細(xì)胞因子以網(wǎng)絡(luò)形式行使生物功能，眾多細(xì)胞因子在機(jī)體內(nèi)相互促進(jìn)或相互抑制。這一特性使我們對細(xì)胞因子的新功能和新細(xì)胞因子受體的存在所知甚少，又因?yàn)閭鹘y(tǒng)實(shí)驗(yàn)方法費(fèi)用高，耗時(shí)長，所以應(yīng)用計(jì)用算

2、方法系統(tǒng)研究細(xì)胞因子-受體相互作用，以揭示細(xì)胞因子的新功能、新受體十分必要。本課題首先建立基于支持向量機(jī)的分類模型，用來從人類蛋白組中預(yù)測新的細(xì)胞因子-受體相互作用，最終得到1609個(gè)新相互作用，由244個(gè)新受體和所有112個(gè)已知受體參與。通過改進(jìn)訓(xùn)練方法，該模型與常規(guī)支持向量機(jī)方法訓(xùn)練的模型相比有較高的準(zhǔn)確性(99.2％)。進(jìn)一步分析顯示，各家族的細(xì)胞因子受體趨向于享有共同的序列模式(Domains/Motifs)，以便保證與細(xì)胞因子