血痕特異性mRNA及microRNA標記的研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、血痕是法醫(yī)物證中最常見的檢材,也是法醫(yī)物證檢驗中最常遇到和最重要的項目。目前常用的血痕檢驗的主要方法包括:生物化學方法、細胞學方法以及免疫學方法。這些方法都存在一定的局限性,如特異度不高、靈敏度較低、容易出現(xiàn)假陰或假陽性、不適合微量檢材等。隨著分子生物學技術的發(fā)展,越來越多的法醫(yī)學研究者從基因表達水平探討了血痕確證的新方法。
   目的:
   1.探討并驗證HBA和SPTB基因mRNA的組織特異性及其在法醫(yī)血痕確證中的

2、應用價值。
   2.探討并驗證miR451和miR16基因的組織特異性及其在法醫(yī)血痕確證中的應用價值。
   3.建立基于目前法醫(yī)DNA分析技術平臺的血痕確證方法,并就其特異性、靈敏度及穩(wěn)定性三個方面與抗人血紅蛋白膠體金試紙進行比較。
   方法:
   1.RNA提取方法的研究:選取6個新鮮血痕樣本,分別用TRIzol法和硅膠柱純化法提取RNA,通過紫外分光光度計和瓊脂糖凝膠電泳對提取的RNA定量和檢

3、測其完整性,選取適合本實驗的RNA提取方法。并用Trizol法同時提取DNA,對DNA進行STR分型檢測。
   2.血痕HBA及SPTB mRNA的特異性研究:收集120份人靜脈血樣(新鮮血痕30份,陳舊血痕90份),6種動物(狗、兔、小鼠、雞、貓、猴)的血痕樣本各1份,精液斑10份、月經(jīng)血痕10份、陰道液斑10份。在NCBI Date Base上查找HBA、SPTB和ACTB的mRNA序列,利用Primer Express(

4、R)2.0軟件設計引物及TaqMan探針,并將設計好的引物序列導入BLAST軟件,以檢驗引物的特異性。利用RT-qPCR法對所有樣本檢測其HBA和SPTB的△CT,并評估其在法醫(yī)學上的應用價值。
   3.血痕miR16及miR451microRNA的特異性研究:利用SPSS16.0統(tǒng)計分析軟件對120份人靜脈血痕進行隨機抽樣,選取60份為microRNA樣本,利用RT-qPCR法對60份血痕、6種動物血、6份陰道液斑、6份精液

5、斑檢測其miR451和miR16的△CT,并評估其在法醫(yī)學上的應用價值。
   4.體液斑特異性mRNA標記的復合檢測:對ACTB、HBA、MMP7、MMP11、KLK3和PRM2標記FAM熒光并建立復合擴增體系,利用聚丙烯酰胺凝膠電泳(PAGE)-銀染法和毛細管熒光電泳法檢測特異性擴增片段。
   5.抗人血紅蛋白金標試紙的評估:用抗人血紅蛋白金標試紙對不同動物血痕、陳舊血痕、逐級稀釋的血液檢測,并與HBA、SPTB、

6、miR451和miR16比較。
   結果:
   1.RNA提取方法的選擇:TRIzol法提取的RNA質量優(yōu)于硅膠柱純化法,對Trizol法同時提取DNA進行STR分型檢測,可以得到理想的STR分型圖譜。
   2.血痕特異性mRNA標記檢測體系:
   (1)設定HBA閾值為0.2,陽性標準為ACTB CT≤35,HBACT≤38且△CT≤-5。對30份新鮮血痕進行檢測,陽性率為97%。在10份陰道液

7、和10份精液未見陽性,組織特異性好。HBA在6份動物血痕均可檢測出CT值,但可以根據(jù)陽性標準與人血區(qū)分。在1μL血液或2ng的RNA模板均可檢出HBA。對保存時間為3個月內(nèi)的血痕CT值變化較大,6個月以上的血痕樣本的CT值趨于穩(wěn)定。
   (2)設定SPTB閾值為0.05,陽性標準為ACTB CT≤35,SPTB CT≤40且4≤△CT≤13,對30份新鮮血痕進行檢測,陽性率為60%。10份陰道液和10份精液假陽性率為30%。在

8、動物血痕中未見陽性。對100μL血液或2ng的RNA模板均可檢出SPTB。CT值在不同保存時間樣本中變化較小,CT值介于39~41之間。
   3.血痕特異性microRNA標記檢測體系:
   (1)設定miR16的閾值為0.2,陽性標準設為RNU6b CT≤40,miR16 CT≤35且△CT≤-13。對15份新鮮血痕進行檢測,陽性率為73%;6份精液和6份陰道液中未見陽性檢出,6種動物血中假陽性率為17%。對100

9、μL血液或68ng的RNA模板均可檢出miR16。在保存20年的血痕中仍有miR16表達。
   (2)設定miR451的閡值設為0.2,陽性標準為RNU6b CT≤40,miR451 CT≤37且△CT≤-12。對15份新鮮血痕進行檢測,陽性率為53%;6份精液和6份陰道液中未見陽性;6份動物血中假陽性率為33%。對100μL血液或68ng的RNA模板均可檢出miR451。在保存20年的血痕中仍有miR451表達。
  

10、 4.體液斑復合擴增體系:以HBA mRNA為血痕特異性標記,與精液和月經(jīng)血的特異性mRNA標記和內(nèi)參基因mRNA標記進行復合檢測。在不同體液斑的特異性片段擴增產(chǎn)物位置有相應產(chǎn)物,組織特異性好。猴血中可以檢測到HBA和ACTB擴增片段,其他動物血中均無HBA和ACTB擴增片段檢出。設HBA的RFUs值>200為陽性,單獨擴增時HBA在1×10-4μL血液和2×10-2ng RNA中仍可檢測到擴增片段并達到陽性標準;復合擴增時在1μL血

11、液和20ng的RNA模板均可檢出HBA。在保存3個月內(nèi)的血痕中檢出HBA。
   5.抗人血紅蛋白膠體金試紙的結果:猴血抗人血紅蛋白膠體金試紙試驗呈陽性反應??蓹z測到的最低血液濃度為1×10-4μL。對于10年內(nèi)的陳舊血痕可呈陽性反應。
   結論:
   1.HBA可作為血痕特異性mRNA標記用于血痕確證,但不適用于常溫下保存時間超過3個月的血痕確證。
   2.SPTB種屬特異性低、組織特異性低及在血

12、痕中含量不穩(wěn)定的缺點,不建議將SPTB作為血痕特異性mRN A標記用于血痕確證。
   3.miR16和miR451可作為血痕特異性microRNA標記用于血痕確證。
   4.毛細管熒光電泳通過檢測復合擴增產(chǎn)物可以同時檢測多種體液斑,是基于現(xiàn)有DNA分型技術確證體液斑的有效方法。
   5.HBA、miR16和miR451可聯(lián)合用于陳舊血痕的確證。
   6.抗人血紅蛋白膠體金試紙在猴血呈陽性結果,在靈

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