Alu序列準(zhǔn)周期模式的初步探討.pdf

1、本論文屬于生物信息學(xué)的研究范疇。對(duì)人類基因組來(lái)說(shuō)，迄今為止，人們真正掌握規(guī)律的只有DNA上的編碼蛋白質(zhì)的區(qū)域（基因），最新資料說(shuō)明這部分序列約占基因組的3％。僅占人類基因組3％的編碼區(qū)的相關(guān)研究已經(jīng)締造了數(shù)十位諾貝爾獎(jiǎng)獲得者，97％非編碼區(qū)蘊(yùn)含的生物信息量將是十分可觀的，因此尋找這些區(qū)域的編碼特征、信息調(diào)節(jié)與表達(dá)規(guī)律是未來(lái)相當(dāng)長(zhǎng)時(shí)間內(nèi)的熱點(diǎn)課題。 在大多數(shù)真核生物的基因組中存在著大量的散置重復(fù)序列，Alu序列屬于中等重復(fù)的短散置

2、序列，約占人類基因組的5％～6％。最近研究表明Alu序列可能與調(diào)控網(wǎng)絡(luò)有關(guān)，調(diào)控散置在基因組中的基因協(xié)同表達(dá)。我們知道，基因中的DNA序列是通過(guò)三聯(lián)體編碼方式?jīng)Q定蛋白質(zhì)序列，那么Alu序列是否具有類似于基因中的三聯(lián)體編碼的編碼性質(zhì)呢？ 本文我們首先嘗試用準(zhǔn)周期的方法在Alu序列中尋找可能的編碼方式，并與外顯子，內(nèi)含子的分析結(jié)果進(jìn)行對(duì)比，結(jié)果顯示Alu序列可能具有8聯(lián)體的編碼方式。同時(shí)Alu序列8聯(lián)體的編碼性質(zhì)也支持了原來(lái)人們?cè)?jīng)

3、提出的Alu序列可能參與表達(dá)調(diào)控的觀點(diǎn)。 為了進(jìn)一步研究Alu序列的準(zhǔn)周期模式，我們分別對(duì)這些序列左右臂的準(zhǔn)周期進(jìn)行了統(tǒng)計(jì)分析，結(jié)果發(fā)現(xiàn)所有序列的右臂顯示出顯著的準(zhǔn)周期8，而左臂則有5或者8的準(zhǔn)周期特點(diǎn)；同時(shí)我們也發(fā)現(xiàn)左臂中的準(zhǔn)周期5有向準(zhǔn)周期8進(jìn)化的趨勢(shì)。這些結(jié)果表明，在進(jìn)化過(guò)程中，Alu序列有比較保守的準(zhǔn)周期8，因而Alu序列可能具有一種或幾種特定的功能。 對(duì)于Alu各家族和各家族左右臂，我們分別統(tǒng)計(jì)了它們?cè)诿總€(gè)周期