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文檔簡介
1、結(jié)核病(tuberculosis,TB)是一種由結(jié)核分枝桿菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)引發(fā)的嚴重危害人類健康的慢性呼吸道傳染病。近些年來,由于耐多藥結(jié)核病(MDR-TB)和廣泛耐藥結(jié)核?。╔DR-TB)的流行及MTB與人類免疫缺陷病毒(Human immunodeficiency virus,HIV)共同感染等原因,古老的結(jié)核病再次成為全球面臨的嚴峻的公共衛(wèi)生挑戰(zhàn)之一。然而,目前診斷結(jié)核病的金標準依
2、然是羅氏固體培養(yǎng),尚無有效、快速診斷結(jié)核病的方法。同時,研究已證實BCG的保護效果不理想,特別是對成年人結(jié)核幾乎無預防效果。結(jié)核分枝桿菌特異性蛋白及其抗原表位的研究,在開發(fā)結(jié)核病新型診斷方法和研究有效的結(jié)核病新疫苗中具有著重要的作用。
本研究采用兩種方法開展了結(jié)核分枝桿菌特異性抗原及人 T細胞表位的研究,以期發(fā)現(xiàn)最佳的新T細胞抗原,為后續(xù)診斷試劑和疫苗研究提供基礎。一方面采用生物信息學方法,排除PE/PPE家族蛋白、轉(zhuǎn)座子及已
3、知抗原表位,對余下的所有蛋白進行系統(tǒng)、全面的人T細胞表位預測,并從中篩選優(yōu)勢表位進行生物合成。合成的表位,采用酶聯(lián)免疫反應斑點法(ELISPOT)進行初步及擴大樣本量兩步驗證。同時對表位集中的預測抗原及已知表位信息的特異性抗原,根據(jù)其編碼基因序列設計引物,分子克隆方法獲得重組質(zhì)粒后,轉(zhuǎn)化入原核表達系統(tǒng)進行表達,經(jīng)Ni親和柱親和層析方法純化,得到各重組蛋白。若重組蛋白為包涵體表達形式,采用透析復性以恢復天然構(gòu)象。最后,建立最佳血清及抗原濃
4、度的酶聯(lián)免疫吸附試驗(ELISA)方法,初步評價重組蛋白的抗原性。
利用TEPredict和IEDB兩個軟件同時預測出了273個抗原蛋白的2726個表位,從中篩選出評分大于5的50個表位,主要分布于Rv1798、Rv0197、Rv0658c、Rv2942及Rv3239c5個抗原。經(jīng)進一步表位優(yōu)化,獲取分布于5個抗原上的32條多肽,由生物公司合成并純化。采集結(jié)核病人血,分離得到外周血單個核細胞(PBMC),ELISPOT方法進行
5、初步篩選。經(jīng)10個細菌學陽性病人血樣本對每條多肽的篩選,獲得6條陽性多肽。對于陽性肽再使用50個細菌學陽性的結(jié)核病人及60個肺部病人和60個健康人作為對照進行驗證。單條肽Rv1798-1、Rv1798-2、Rv0197、Rv0658c、Rv2942、Rv3239c的靈敏度分別為12.0%、18.0%、20.0%、8.0%、10.0%、4.0%,特異度均在99%以上。抗原Rv1798兩條多肽聯(lián)合靈敏度為24.0%,而特異度達到100%。由
6、此可見,多肽聯(lián)合用于結(jié)核病的診斷價值,遠遠高于單條多肽。
同時,我們選擇了10個特異性蛋白抗原進行分子克隆及原核表達。本研究成功構(gòu)建了相應抗原的重組質(zhì)粒,表達純化得到GroES、LpqH、PstS3、PPE18、PPE19、GlnA1、PlcA和EccA58種重組蛋白(其中兩個重組質(zhì)粒未表達成功)。進一步采用ELISA方法評價了這些蛋白在血清學中的診斷價值??乖璆roES、PPE18、PPE19、GlnA1及EccA5的診斷價
7、值較高,曲線下面積(AUC)大于80%,其中靈敏度分別為72.1%、76.8%、59.0%、66.8%、66.8%,特異度分別為81.4%、78.4%、92.2%、78.4%、83.3%。抗原LpqH、PstS3和PlcA的AUC也均大于70%,其靈敏度分別為66.3%、52.1%、75.3%,特異度分別為68.6%、88.2%、65.7%。
綜上所述,本研究首次采用TEPredict和IEDB兩個軟件同時對結(jié)核分枝桿菌毒力相
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