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文檔簡介
1、第一部分鱗翅目昆蟲Cry毒素受體與人類的同名蛋白的生物信息學分析
背景:
Cry毒素是蘇云金芽孢桿菌(Bacillus thuringiensis, Bt)產生的一種殺蟲晶體蛋白,已廣泛應用于鱗翅目、雙翅目、鞘翅目、膜翅目等害蟲的生物防治。Cry毒素的殺蟲機制主要包括細胞穿孔模型和信號轉導細胞凋亡模型,雖然兩種模型仍有爭議,但Cry毒素受體在兩種模型中都具有重要的作用[1,2,3]。Cry毒素受體主要有氨肽酶 N(a
2、minopeptidase-N, APN)[4]、類鈣黏蛋白(Cadherin-like protein, CaLP)[5]、堿性磷酸酶(alkaline-phosphatase, ALP)[6]和糖脂類[7]。人體同樣存在APN、CaLP、ALP三種蛋白,其與鱗翅目昆蟲Cry毒素受體的異同以及是否具有Cry毒素受體的功能至今鮮見報道。利用生物信息學技術分析鱗翅目昆蟲Cry毒素受體APN、CaLP、ALP與人類的同名蛋白之間的關系,有利
3、于探討人體內是否存在 Cry毒素受體或類似物,為評價Cry毒素的安全性提供理論依據。
目的:
分析鱗翅目昆蟲Cry毒素受體氨肽酶N(APN)、類鈣黏蛋白(CaLP)、堿性磷酸酶(ALP)與人類的同名蛋白之間的關系,探討人體內是否存在Cry毒素受體或類似物。
方法:
從NCBI數據庫獲取人類和鱗翅目昆蟲的APN、CaLP、ALP的氨基酸序列,利用Clustalx1.83、Clustal Omega、
4、MEGA6.0、InterPro、SWISS-MODEL及FATCAT等軟件和在線服務器對序列一致性、系統(tǒng)發(fā)育關系、結構域、三維結構相似性等進行預測和分析。
結果:
APN系統(tǒng)發(fā)育關系最近的是人類與家蠶,兩者序列一致性最高58.06%、含2個相同的結構域、三維結構相似性顯著(62.80%,P﹤0.05),且兩者都含有潛在的O糖基化和N糖基化位點。ALP系統(tǒng)發(fā)育關系最近的是人類與家蠶,兩者序列一致性最高46.03%、含
5、2個相同的結構域、三維結構相似性顯著(59.63%和59.59%,P﹤0.05)。人類與鱗翅目昆蟲的CaLP系統(tǒng)發(fā)育關系較遠;CaLP序列一致性最高是人類與棉鈴蟲(28.12%),兩者含2個相同的結構域、三維結構相似性不顯著(18.75%, P﹥0.05)。
結論:
人類和家蠶的APN、ALP系統(tǒng)發(fā)育關系最近、序列一致性最高、含有相同的結構域且三維結構相似性顯著;人類與家蠶的APN均含有潛在的O糖基化和N糖基化位點。
6、因此,預測人類的APN、ALP與家蠶的APN、ALP可能具有相似的生物學功能。由于家蠶的APN、ALP具有Cry毒素受體的生物學功能,因此推測人類的APN、ALP也可能具有類似Cry毒素受體的功能,但仍需進一步實驗驗證。
第二部 Cry2Aa蛋白的果蠅表達體系構建
背景:
蘇云金芽孢桿菌產生的 Cry蛋白對鱗翅目、鞘翅目等昆蟲具有殺蟲活性,因而被作為有效的生物殺蟲劑廣泛應用于農林業(yè)害蟲的防治。隨著轉基因技術
7、的發(fā)展, Cry蛋白在抗蟲轉基因作物的應用也越來越多,目前國內外已成功培育出轉基因玉米、水稻、油菜、棉花等多種抗蟲轉基因作物。由于外源基因的插入可能會引起次級效應和位置效應,因此轉基因作物可能存在一些潛在的風險。目前,轉基因作物的食用安全性和生態(tài)安全性越來越受關注。其中,轉基因作物的過敏原性評價是研究重點之一,而獲得一定量的外源蛋白是進行過敏原性評價的基礎。另外,我們已經通過生物信息學預測人類的APN和ALP可能具有類似Cry毒素受體的
8、功能,進一步的實驗驗證需要 Cry蛋白作為實驗材料。果蠅表達系統(tǒng)結合了昆蟲表達系統(tǒng)和哺乳動物細胞表達系統(tǒng)的優(yōu)點,減少內毒素的影響,能夠直接產生高效且穩(wěn)定表達外源蛋白的昆蟲細胞系,具有較好的應用前景。
目的:
將Cry2Aa基因克隆進果蠅表達載體pAc5.1/V5-His中,構建Cry2Aa-pAc5.1瞬時轉染質粒。另外,在Cry2Aa基因的5’端添加一個帽子結構和Kozak序列從而獲得C2A33目的基因,并將其克隆
9、進果蠅表達載體pMK33/pMtHy中,構建C2A33-pMK33穩(wěn)定轉染質粒。將這兩種重組質粒分別采用瞬時轉染和穩(wěn)定轉染的方法轉入果蠅S2細胞,從而構建Cry2Aa蛋白的果蠅表達體系。表達的Cry2Aa蛋白可作為評價Cry2Aa蛋白過敏原性及實驗驗證人類的APN和ALP是否具有Cry毒素受體功能的實驗材料。
方法:
1、根據Cry2Aa基因序列和實驗要求設計PCR引物,由鉑尚生物技術(上海)有限公司合成。
10、 2、PCR擴增獲得Cry2Aa目的基因,將其克隆進pEASY–Blunt Simple Cloning Vector并進行菌落PCR和雙酶切鑒定;將鑒定正確的目的基因克隆進果蠅表達載體pAc5.1/V5-His中,構建Cry2Aa-pAc5.1瞬時轉染質粒,進行菌落PCR、雙酶切和測序鑒定。
3、PCR擴增獲得C2A33目的基因,將其克隆進pEASY–Blunt Simple Cloning Vector并進行菌落 PCR和
11、雙酶切鑒定;將鑒定正確的目的基因克隆進果蠅表達載體pMK33/pMtHy中,構建C2A33-pMK33穩(wěn)定轉染質粒,進行菌落PCR、雙酶切和測序鑒定。
結果:
1、構建了Cry2Aa蛋白的瞬時轉染質粒Cry2Aa-pAc5.1。
2、構建了Cry2Aa蛋白的穩(wěn)定轉染質粒C2A33-pMK33。
結論:
本研究構建了 Cry2Aa蛋白的瞬時轉染質粒 Cry2Aa-pAc5.1和穩(wěn)定轉染質粒
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