模擬微重力環(huán)境對(duì)牙齦卟啉單胞菌全基因表達(dá)影響研究.pdf

1、目的：
　　本課題通過(guò)觀察牙周致病菌牙齦卟啉單胞菌ATCC33277在模擬微重力環(huán)境下細(xì)菌生長(zhǎng)和全基因表達(dá)，研究相關(guān)差異基因在牙齦卟啉單胞菌模擬微重力環(huán)境中參與應(yīng)答、代謝過(guò)程的變化，旨在揭示模擬微重力環(huán)境對(duì)牙齦卟啉單胞菌增殖、全基因表達(dá)的影響，為指導(dǎo)和維護(hù)航天員的口腔健康提供實(shí)驗(yàn)依據(jù)。
　　材料和方法：
　　本研究使用美國(guó)NASA研發(fā)的旋轉(zhuǎn)細(xì)胞培養(yǎng)系統(tǒng)RCCS-4地面模擬系統(tǒng)模擬微重力環(huán)境,以牙齦卟啉單胞菌ATCC33

2、277為研究對(duì)象，設(shè)為實(shí)驗(yàn)組（模擬微重力）和對(duì)照組，分別培養(yǎng)、記錄生長(zhǎng)曲線，利用高通量轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的方法根據(jù)有生物學(xué)重復(fù)實(shí)驗(yàn)標(biāo)準(zhǔn)設(shè)定padj＜0.05為閾值篩選差異表達(dá)的基因，分析差異基因聚類和GO、KEGG富集功能集團(tuán)。
　　結(jié)果：
　　1.模擬系統(tǒng)模擬微重力環(huán)境下牙齦卟啉單胞菌生長(zhǎng)曲線，靜止期和平臺(tái)期實(shí)驗(yàn)組和對(duì)照組變化無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義（P＞0.05），對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期兩組差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義（P＜0.05），實(shí)驗(yàn)組較對(duì)照組細(xì)菌增殖加快。

3、
　　2.轉(zhuǎn)錄組測(cè)序發(fā)現(xiàn)，實(shí)驗(yàn)組71個(gè)基因差異表達(dá)，12個(gè)上調(diào)的基因包括參與編碼血細(xì)胞凝集素HagA的基因，編碼結(jié)合轉(zhuǎn)座子TraG的基因等。59個(gè)下調(diào)的基因有包括編碼細(xì)菌鞭毛fimA、fimC、fimD、fimE、mfal的基因等。
　　3.通過(guò)對(duì)差異基因的富集和GO、KEEG聚類分析發(fā)現(xiàn)在模擬微重力環(huán)境下，牙齦卟啉單胞菌通過(guò)調(diào)整DNA復(fù)制、氧化物/超氧化物代謝活性、宿主間和細(xì)胞間的信號(hào)傳播和運(yùn)動(dòng)、ATP酶跨膜轉(zhuǎn)運(yùn)活動(dòng)。