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文檔簡介
1、新疆農(nóng)業(yè)大學(xué)碩士學(xué)位論文扁桃花粉AcSFB基因的克隆及其表達(dá)分析姓名:郭長奎申請學(xué)位級(jí)別:碩士專業(yè):生物化學(xué)與分子生物學(xué)指導(dǎo)教師:羅淑萍20090601TheCloningandExpressionAnalysisofPollenAcSFBGenesfromAlmond似mygdaluscommunisL)AbstractAlmond似mygdaluscommunis工)isthediploidmemberofRosaceaeandis
2、crosspollinatdandselfincompatibleplantStyleS—determinantshavebeendeterminedtobeSRNaseandtheSFB(Shaplotype—specificFboxproteingene)allelesareconsideredtobethefirstcandidatesofthepollenSdeterminantsNowthereisnotanyresearch
3、ofalmondpollenGSIinXinjiangInthisstudy,theinitialaimWaStoisolateandcharacteriseAcSFBallelegenesfromalmondcultivarinXinjiangChinatogainfurtherunderstandingoftheevolutionaryrelationshipsandphylogenyofSFBalleleswithinPrunus
4、ExpressionanalysisandsemiquantitativeRTPCRwereusedtofindwhichtissuecouldexpressSFBproteinandwhichfloweringperiodexpressedmore5’UTRand3’UTRanalysisandbioinformaticsanalysisstillhadstudiedinthisexpedmentThestudyofalmondsel
5、fincompatiblemechanismusingmolecularbiologicaltechnologywouldfastpromotetheindustryofalmondAllresultsweresummarizedasfollows:1TotalRNAfromalmondantherwasextractedwiththeimprovedCTABmethodThealmondantherRNAobtainedWas900d
6、integrityandwithoutstainofpolysaccharideandprotein,whoseyieldwasveryhi曲2Inthisstudy,fifteennovelAcSFBgenes(GenBankaccessionnumbers:EU909685,F(xiàn)J362524FJ362529,F(xiàn)J231204,F(xiàn)J415321andFJ514935~FJ514940)wereidentificatedusingRT—
7、PeRandRACEtechnolgyinAcommunismainlyplantedinChinaforthefirsttime而eidenffiedAcSFBgenesshowedShaplotypespecificpolymorphismTheseallelesencodedproteinswiththeFboxmotifintheN—aminoterminus,andwithfour(hyper)variableregions,
8、ie,V1,V2,HvaandHvb,consideredtoberecognitionsitebetweenSFBandSRNaseanddeterminedGSIWiththebioinformaticsanalysis,theAcSFBproteinswereinstable,hydrophilicityandnonsecretoryproteinandhadligaseorlyaseenzymeactivity3Usingthe
9、DNAMANsoft,phyletieevolutiontreewasconstructedTheresultshowedtheinterspeciesaminoacididentitiesobtainedbycomparisonwithotherPrunusSFBswereoftenhigherthanintraspeciesidentitiesTheevolutionrelationshipofpollenSgenesbetween
10、ChineseandAmericanalmondsWasreciprocalchiasmataandtherewerenoplacesdifferences4AcSFBgeneWasexpressedonlyinpollenandnotinotherorgan,whichshowedAcSFBexpressionhadorganspecificityTheAcSFBWasexpressedmoreinballstagethaninoth
11、erstage,whichwouldgiveareferenceforarrayingpollenizerStudyonexpresspaRemofAcSFBmaycontributetoconfirmationthattheAcSFBgeneisthepollenSdeterminantStillweprovedtherewasnointronintheAcSFBgenesandasingleintronhadbeenfoundint
12、hes’untranslatedregionoftheAcsFBgenesofalmond5ThevectorofpETAcSFBWasconstructed,aftertransformedtoEscherichiacoliBL21andinducedbyisopropyl—pD—thiogalactopyranoside(IPTG),recombinantproteinabout60kDwasexpressedinpETAcSFBs
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