掛榜山小鯢線粒體基因全長測定及小鯢科系統(tǒng)發(fā)育分析.pdf

1、線粒體是存在于絕大多數(shù)真核生物細胞內(nèi)的一種基本的、重要的細胞器。脊椎動物線粒體DNA(mitochondrial DNA，mtDNA)是共價閉合的環(huán)狀雙鏈DNA，能進行自我復(fù)制，具有嚴(yán)格的母系遺傳特性，在世代傳遞過程中不發(fā)生基因重組。mtDNA已被廣泛應(yīng)用于脊椎動物進化遺傳學(xué)和種群遺傳學(xué)的研究，為從分子水平上解決物種的系統(tǒng)發(fā)育問題提供了理想的研究材料。
　　 掛榜山小鯢(Hynobius guabangshanensis)隸屬于

2、兩棲綱(Amphibia)、有尾目(Urodela)、小鯢科(Hynobiidae)。本研究通過通用引物測出幾個基因片段然后通過LA-PCR擴增出兩個基因之間的長片段，再用PCR引物步移測序等方法，測定了掛榜山小鯢線粒體全長。測序結(jié)果利用DNAStar軟件包中的Megalign程序?qū)ν葱蛄羞M行排列，并經(jīng)人工仔細核查。實驗分析結(jié)果表明：掛榜山小鯢線粒體全長為16408bp，其中A為5484個，占33.4％；C為3478個，占21.2％；

3、G為2255個，占13.7％；T為5191個，占31.6％。A+T含量明顯大于G+C含量。
　　 小鯢科物種截止2009年10月共有19個物種測定了線粒體基因全序列。本文利用MEGA4.0對NCBI上19個小鯢科物種線粒體基因全序列進行了比對，并選取了線粒體上幾個基因進行系統(tǒng)進化分析，計算不同序列間的堿基組成、變異位點、簡約信息位點數(shù)、轉(zhuǎn)換/顛換比等等；用MEGA4.0軟件基于P-distance模型構(gòu)建19個小鯢科物種的遺傳距