黔北地區(qū)人群MTHFR基因多態(tài)性與NSCL-P的相關(guān)性研究.pdf

1、目的：
　　通過檢測黔北地區(qū)NSCL/P患者核心家系和對照組核心家系MTHFR基因C677T及A1298C位點多態(tài)性，了解其等位基因及基因型的分布特點，并探討基因多態(tài)性與NSCL/P的相關(guān)性。
　　方法：
　　1.收集45例對照組核心家系和60例NSCL/P核心家系的外周靜脈血，提取其基因組DNA，并采用瓊脂糖凝膠電泳檢測DNA的提取質(zhì)量；
　　2.根據(jù)MTHFR基因C677T及A1298C位點多態(tài)性設(shè)計上下游引

2、物，采用PCR及二代測序技術(shù)對病例組及對照組核心家系樣本進行SNPs檢測，在線BLAST比對擴增序列，檢測是否為研究的目的片段。采用chromas序列讀取軟件和MEGA7序列分析軟件進行基因分型，應(yīng)用 SPSS19.0統(tǒng)計學(xué)軟件行數(shù)據(jù)分析，以卡方檢驗進行Hardy-Weinberg平衡檢驗，并比較各組間各基因型及等位基因頻率的分布特點；
　　3.采用病例父母對照研究對病例組核心家系等位基因進行HHRR分析，雜合子父母及患兒進行TD

3、T檢驗，并對病例組及對照組父母突變等位基因進行合并分析，進一步探討病例組及對照組核心家系MTHFR基因C677T及A1298C多態(tài)性位點與NSCL/P的相關(guān)性。
　　結(jié)果：
　　1.本研究對照組及病例組核心家系均未檢測出MTHFR基因C677T位點純合及雜合突變；而A1298C位點則檢測出突變；
　　2.以對照組和病例組核心家系MTHFR基因A1298C位點基因型的觀察值和期望值進行Hardy-Weinberg平衡檢驗

4、，對照組和病例組子代、母親、父親結(jié)果均無統(tǒng)計學(xué)差異(P＞0.05)，其結(jié)果顯示兩核心家系均符合Hardy-Weinberg平衡法則，表明研究樣本具有群體代表性；
　　3.對照組與病例組核心家系子代及父親的A1298C位點基因型及等位基因的頻率分布差異均無統(tǒng)計學(xué)意義(P＞0.05)，母親A1298C位點基因型及等位基因頻率分布有統(tǒng)計學(xué)差異(P＜0.05)，其中母親CC基因型相對于AC和AA基因型的OR值和95％CI分別為OR＝0.1

5、42(95%CI：0.027～0.745)和OR＝0.135(95%CI：0.026～0.687)，突變等位基因C相對于等位基因A的OR＝0.525(95%CI：0.289～0.953)；
　　4.將病例組核心家系雙親的基因型及等位基因進行合并與子代比較，其基因型之間無統(tǒng)計學(xué)差異(P＞0.05)，突變等位基因也無統(tǒng)計學(xué)意義(P＞0.05)；
　　5.在基于HHRR關(guān)聯(lián)法分析中，以病例組核心家系父母傳遞給患病子女的兩個等位基因

6、構(gòu)成為“病例組”和未傳給子女的兩個等位基因構(gòu)成的虛擬“對照組”進行比較分析，結(jié)果顯示MTHFR基因A1298C多態(tài)性與NSCL/P無顯著關(guān)聯(lián)性(P＞0.05)；
　　6.根據(jù)病例組父母基因型在患病子女中的傳遞情況，去除兩位點純合子父母家系，進行TDT檢驗，結(jié)果顯示A1298C多態(tài)性位點與NSCL/P患者之間未發(fā)現(xiàn)存在連鎖不平衡(P＞0.05)；
　　7.將病例組與對照組父母總的突變等位基因進行合并分析，兩組父母突變等位基因頻

7、率分別為23.75%和34.44%，經(jīng)檢驗差異無顯著性統(tǒng)計學(xué)意義(P＞0.05)。
　　結(jié)論：
　　1.在本研究觀察范圍內(nèi)未檢測出病例組及對照組家系MTHFR基因C677T位點純合及雜合突變；
　　2.MTHFR基因A1298C位點多態(tài)性可能不是黔北地區(qū)NSCL/P患者的發(fā)病因素，且母親MTHFR基因A1298C位點多態(tài)性可能是子代患病的保護因素；
　　3.黔北地區(qū)NSCL/P患者MTHFR基因A1298C位點未