珍稀泌鹽植物長(zhǎng)葉紅砂SSR分子標(biāo)主的開發(fā)及種群遺傳學(xué)研究.pdf

1、長(zhǎng)葉紅砂（Reaumuria trigyna）隸屬于檉柳科(Tamaricaceae)紅砂屬(Reaumuria)，屬中國(guó)特有種，僅分布于中國(guó)的內(nèi)蒙古及寧夏地區(qū)，為強(qiáng)旱生耐鹽小灌木，被認(rèn)定為古地中海珍稀孑遺植物。生境片段化是長(zhǎng)葉紅砂面臨的生存威脅之一，使得長(zhǎng)葉紅砂原本連續(xù)的大種群變成多個(gè)孤立的小種群，種子擴(kuò)散和種群的建立受到限制，對(duì)其種群間基因交流和移居活動(dòng)產(chǎn)生直接障礙，加速種群數(shù)量的下降，開展長(zhǎng)葉紅砂種群遺傳學(xué)研究，有助于深入了解長(zhǎng)葉

2、紅砂進(jìn)化潛力及適應(yīng)機(jī)制。本研究利用從長(zhǎng)葉紅砂轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)中開發(fā)出的10個(gè)SSR標(biāo)記，選取長(zhǎng)葉紅砂分布區(qū)10個(gè)種群（其中內(nèi)蒙古7個(gè)種群，寧夏3個(gè)種群）為研究對(duì)象，對(duì)10個(gè)種群的200個(gè)長(zhǎng)葉紅砂個(gè)體進(jìn)行種群遺傳多樣性和遺傳結(jié)構(gòu)研究，分析其進(jìn)化潛能及生存風(fēng)險(xiǎn)，為進(jìn)一步開展該植物保護(hù)生物學(xué)奠定基礎(chǔ)。
　　本研究主要內(nèi)容包括：⑴在長(zhǎng)葉紅砂耐鹽轉(zhuǎn)錄組深度測(cè)序基礎(chǔ)上搜索并篩選出10個(gè)具有多態(tài)性的SSR位點(diǎn)。利用長(zhǎng)葉紅砂中的10對(duì)多態(tài)性引物在紅砂基

3、因組DNA中進(jìn)行引物通用性鑒定，得出Unigene7818、Unigene32181、Unigene27927三對(duì)引物在紅砂中鑒定效果明顯，可以應(yīng)用于紅砂研究中。⑵對(duì)10個(gè)SSR位點(diǎn)進(jìn)行中性位點(diǎn)檢驗(yàn)，結(jié)果顯示在95％的置信區(qū)間內(nèi)，7個(gè)位點(diǎn)為中性進(jìn)化位點(diǎn)，3個(gè)位點(diǎn)為平衡選擇作用位點(diǎn)。⑶10對(duì)SSR引物共檢測(cè)出29個(gè)多態(tài)性位點(diǎn)，各個(gè)SSR位點(diǎn)的多態(tài)性信息含量值變化范圍從0.2352到0.5019，其中(GCT)6位點(diǎn)的為高度多態(tài)性標(biāo)記。⑷長(zhǎng)

4、葉紅砂種群的遺傳多樣性分析顯示，長(zhǎng)葉紅砂種群內(nèi)遺傳多樣性較低，種群內(nèi)遺傳變異大于種群間遺傳變異，各個(gè)種群間遺傳分化度較大，存在遺傳漂變和嚴(yán)重的近交現(xiàn)象。⑸采用STRUCTURE、UPGMA、PCA三個(gè)軟件對(duì)200個(gè)長(zhǎng)葉紅砂個(gè)體進(jìn)行聚類分析，研究結(jié)果均為所有個(gè)體分為兩個(gè)亞群，因此推測(cè)長(zhǎng)葉紅砂的兩個(gè)亞群很可能是該物種在冰期避難所的殘留代表。⑹針對(duì)長(zhǎng)葉紅砂生長(zhǎng)現(xiàn)狀提出切實(shí)可行的保護(hù)措施:加強(qiáng)居民瀕危植物的保護(hù)意識(shí)，建立保護(hù)區(qū);定期在保護(hù)區(qū)內(nèi)播