應(yīng)用EST分析和cDNA微陣雜交研究肝癌差異表達(dá)基因.pdf_第1頁
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1、復(fù)旦大學(xué)碩士學(xué)位論文應(yīng)用EST分析和cDNA微陣雜交研究肝癌差異表達(dá)基因姓名：康波愈申請學(xué)位級別：碩士專業(yè)：病原生物學(xué)指導(dǎo)教師：趙新泰2001.4.25應(yīng)用EST分析和cDNA徽陣雜交研究肝癌差異表達(dá)基闌ABSTRACTLivercanceThasseriouslythreatenedlifeandhealthofhumansforalongtimeGeneschangealotduringprogressionofHepatocell

2、ularCarcinoma(HCC)ItisnecessarytoinvestigategenealterationonthewholegenomesoastoknowmoreaboutcarcinogenesisofHCCHavinggrownupinHumanGenomeProjectandappliedinrelevantresearchworkESTanalysisandeDNAmicroarraymakeitpossible1

3、90astingHCC—relatedgenesselectedfromgeneswhichincreaseordecrease也eirexpressioninHCCTitreofHCCcDNA1ibrariesis2100p。figmlandthatofsurroundingnontumortissuecDNA1ibrariesis15100pfu／m195％ofI／a／Isformedrecombinantplasmidsconta

4、ininsertedDNAfragmentswhoseaveragelengthare15kbRandomlychosen34，875ESTsaresequenced，17，821ofwhicharefromHCClibrariesandtheother17，054arefromnon—tumorlibrariesBioinformaticsindicatesthat1401ES“Isarehomologuesofmitochondri

5、onDNAAluandLtseqUenCeSthatneednottobeanalysed646‰ftheanalysedare2l，625homologuesofknowngenes，217％ofwhichare7，253homologuesofknownESTsaswellastheremaining137％areclonesofnovalES“Iswhosetotalnumberis4，5961l，065clustersarees

6、tablishedbysoftwareCAT35Someofthemosthighlyexpressedinnontumortissuesuchasgenesofsertnnalbuminfibdnogenandalphalantichymotrypsinplayimportantrolesinnormalliverwhiletheyandgenesofaldolaseandaleoholdehydrogenasedecreasethe

7、expressioninHCCNormalliverisdamagedintheprocessofcarcinogenesiswiththehi曲lyexpressedspecificalphafetoproteinHCCdistinguishes鼢nsurroundingnon—ttln10rtissueinthat385ESTsfromHCCelevatetheirexpressionand273ESTsgointheopposit

8、ecomparedwiththosefromnonKlmorsothatexpressionmapsofthetwotissueshavealotofdifference87lclonesarepickedupandundergoaproceduretomakecDNAmicroarraysinordertotestifythedifferenceofexpressionshownbvESTanalysismRNAfromHCCandt

9、hesurroundingnontumortissuearetranscriptedintocDNAprobesandhybridizedwithcDNAmicroarrays51genesandESTsincreasetheexpressionincludinggenesofribosomalpmteinscellcycleregulatoryfactorsandrasfamilymembers、礬也the42genesandESTs

10、decreasingtheirexpressioninHCCthatthereisdeftnitecharacteristicsintheprogressionofHCCandtheresultedexpressionm∞comestomakesenseSemiquantitativeRT_PCRisadoptedtoverifyconclusionsdrawnbyESTanalysisandcDNAmicroarrayGenesofA

11、FPNLPlandRho8increasetheexpressionaftercarcinogenesisinliverSodoes】二4強(qiáng)boxbindingproteinassociatedfactorGin30％ofthetestedcasesResultsaresimilareventhou曲theyalefromdifferentwaysESTanalysisandcDNAmicroarrayhavevalBeontheexp

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