中國(guó)地區(qū)H3N2亞型人流感病毒NS1基因分子進(jìn)化研究.pdf

1、甲型H3N2流感病毒是威脅人類健康的重要病原體之一，中國(guó)地區(qū)是世界上流感變異株策源地之一，NS1基因是流感病毒主要的毒力因子之一，對(duì)其變異規(guī)律進(jìn)行深入的分析研究在流感的防治工作中具有重要的參考意義。本研究借助近年來(lái)發(fā)展起來(lái)的初步的數(shù)據(jù)挖掘技術(shù)和進(jìn)化樹(shù)分析方法，從生物信息學(xué)的角度對(duì)流感病毒H3N2/NS1基因的變異規(guī)律進(jìn)行了系統(tǒng)研究，主要包括以下內(nèi)容： 1、聚類分析對(duì)序列的變異規(guī)律進(jìn)行初步分析 應(yīng)用兩步聚類法進(jìn)行了NS1序

2、列的類別分析，結(jié)果顯示全部H3N2/NS1序列可以被清楚的分為4類，各類在宿主間的分布特征清楚的反映了不同宿主序列間親緣關(guān)系的遠(yuǎn)近，而時(shí)間分布上則反映了H3N2/NS1基因在人群中不斷傳播和變異的過(guò)程。 2、序列的進(jìn)化樹(shù)分析 分析結(jié)果顯示，進(jìn)化樹(shù)結(jié)構(gòu)和聚類結(jié)果基本一致，相應(yīng)結(jié)果不僅詳細(xì)刻畫(huà)了數(shù)十年來(lái)H3N2流感病毒NS1基因變異的基本規(guī)律，還解釋了兩個(gè)關(guān)鍵問(wèn)題：豬宿主在人流感病毒變異中起基因混合器的作用；與全球其余地區(qū)相

3、比，中國(guó)南部地區(qū)在人H3N2亞型流感病毒的NS1變異中顯示出早期策源地，但并不是后期主要的變異株起源地。 3、正向選擇位點(diǎn)鑒定 運(yùn)用正向選擇模型分析了所有H3N2/NS1序列信息。結(jié)果表明，人流感病毒H3N2/NS1基因所承受的選擇壓力是逐漸增大的，并且在90年代年后期達(dá)到高峰。在被篩選出的10個(gè)正向位點(diǎn)中，絕大多數(shù)都具有適應(yīng)性進(jìn)化的重要意義。 本研究在回答流行病學(xué)問(wèn)題的同時(shí)，還試探性地建立遺傳序列變異規(guī)律研究的