稻瘟病菌3端非翻譯區(qū)和水稻胚乳基因的生物信息學分析.pdf

1、本文對稻瘟病菌3端非翻譯區(qū)序列進行了相關生物信息學數(shù)據(jù)挖掘和分析，給出了稻瘟病菌mRNA poly(A+)位點周圍3'末端加工相關順式作用元件分布的總體結構模型。其中上游遠端調控元件有T-rich、TG-rich和GA-rich元件；上游近端調控元件主要包括T-rich和A-rich元件；下游近端調控元件主要包括T-rich、A-rich和TGAT元件；下游遠端調控元件主要為T-rich元件，可能是一類輔助元件。本文還發(fā)現(xiàn)超過三分之一的

2、稻瘟病菌基因存在2個以上polyA位點。 水稻胚乳在稻谷發(fā)芽生長過程起著重要作用，并且決定著稻米的品質。目前對于胚乳全局基因表達譜知之甚少，為更好的了解水稻胚乳相關基因的表達情況，本文采用表達序列標簽技術對胚乳cDNA文庫進行了測序。同時基于EST結果構建了cDNA陣列，與來自水稻不同組織或器官的cDNA進行雜交，用以檢測胚乳特異高表達基因。EST結果表明醇溶谷蛋白、谷蛋白、過敏蛋白以及淀粉合成酶編碼基因在胚乳中高度冗余，約占胚