基于轉座子聚集性的轉座子預測工具.pdf

1、理論上而言，生物體中的轉座行為呈隨機性，在基因組中只有小部分區(qū)域沒有轉座子的存在。但據(jù)實際觀察來看，轉座子在基因組中的分布呈現(xiàn)高度的非隨機性，并且不同的種群之間分布規(guī)律也各不相同。基于目前的實驗可以發(fā)現(xiàn)轉座子的分布方式大致可以分為兩種：一種遠離編碼區(qū)，并通過甲基化或呈異染色狀態(tài)來保持活性；另一種則插入到編碼區(qū)或者編碼區(qū)附近。導致轉座子非隨機分布的因素大致也可分為兩類：一類為對插入到編碼區(qū)的轉座子的自然選擇作用，另一類為染色體的重組導致轉

2、座子的數(shù)量的減少?；谝陨侠碚摽芍?，轉座子的非隨機分布很可能在基因組的某些區(qū)域形成一些轉座子的聚集區(qū)，而這些聚集區(qū)又與編碼區(qū)的位置以及重組熱點有關。研究轉座子的聚集區(qū)對研究轉座子的分布規(guī)律，以及功能基因的位置有重要意義。
　　 本文在第三部分通過數(shù)學方法證實了在生物基因組中轉座子聚集區(qū)存在的可能性，然后使用密度聚類算法對dictyostelium discoideum等4種模式生物的轉座子在其基因組中的分布進行研究，并提供了識別