細(xì)胞周期蛋白生物信息學(xué)分析.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、細(xì)胞周期蛋白是細(xì)胞分裂中重要的調(diào)控因子之一,在細(xì)胞周期中,周期蛋白結(jié)合并激活CDK活性,發(fā)揮對(duì)細(xì)胞周期的調(diào)控作用。前人研究表明周期蛋白在分子結(jié)構(gòu)上有一段保守的250個(gè)左右氨基酸殘基的cyclin core結(jié)構(gòu)域,cyclin core包含2個(gè)結(jié)構(gòu)域:cyclin_N(N端cyclin box)和cyclin_C(C端cyclin box)。本實(shí)驗(yàn)以GeneBank為數(shù)據(jù)庫,選取了其中10個(gè)模式物種的365條周期蛋白序列作為基礎(chǔ)數(shù)據(jù),并按

2、它們的結(jié)構(gòu)域特點(diǎn)進(jìn)行分類。重點(diǎn)分析了完整雙域和完整單一cyclin box域這兩種情況,然后對(duì)構(gòu)建出的系統(tǒng)發(fā)育樹中一些特殊周期蛋白進(jìn)行了分析,從而總結(jié)出如下幾點(diǎn)主要結(jié)論:
  1、越是高等的生物含有周期蛋白的不論種類和數(shù)量都要越多,這也表明了高等生物有著更復(fù)雜的細(xì)胞周期調(diào)控機(jī)制。動(dòng)物的周期蛋白種類要普遍多于植物、真核單細(xì)胞生物和原核生物中的,但植物中含有的大多數(shù)亞型成員要多于動(dòng)物中的。
  2、cyclin_C結(jié)構(gòu)域在某些周

3、期蛋白中是一個(gè)重要的結(jié)構(gòu),它對(duì)這些周期蛋白在細(xì)胞周期所發(fā)揮的功能有著很大的聯(lián)系。
  3、在真核單細(xì)胞周期蛋白序列中,G2/M期的周期蛋白都含有雙結(jié)構(gòu)域,而G1/S期的周期蛋白絕大多數(shù)都出現(xiàn)在單域中,不含有cyclin_C結(jié)構(gòu)域。
  4、不同物種間命名不同的周期蛋白可能會(huì)在它們各自的細(xì)胞周期中發(fā)揮相似的作用,如植物cyclin U/P和動(dòng)物cyclin Y的關(guān)系;同種物種內(nèi)一些周期蛋白可能會(huì)取代此物種所缺乏的周期蛋白的作用

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