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1、含BPI結(jié)構(gòu)域超家族由一類能結(jié)合轉(zhuǎn)運脂分子的蛋白所組成,根據(jù)來源和大小不同,主要分為兩個亞家族:類BPI蛋白家族和類Takeout蛋白家族。PLUNC蛋白是最近發(fā)現(xiàn)的在哺乳動物呼吸系統(tǒng)特異分布的蛋白,根據(jù)基因定位和序列比對分析,可能含有一個或者兩個BPI結(jié)構(gòu)域。人源SPLUNC1是PLUNC家族最重要的一個蛋白,含有一個BPI結(jié)構(gòu)域,在天然免疫系統(tǒng)發(fā)揮了重要作用。SPLUNC1能夠結(jié)合LPS分子,具有殺菌作用,而且是表面活性劑蛋白。由于
2、SPLUNC1的溶解度很低,為了獲得SPLUNC1的晶體結(jié)構(gòu),我們將SPLUNC1融合于MBP標簽之后,獲得了可溶性的融合蛋白。經(jīng)過篩選優(yōu)化,我們獲得了分辨率為2.5(A)的融合蛋白的晶體。使用單波長反常散射,我們解析了硒代SPLUNC3A的晶體結(jié)構(gòu)。
SPLUNC1含有一個BPI桶狀結(jié)構(gòu)域,由α螺旋和一個β折疊片組成,在C末端還有一段螺旋α4堵在桶的一端。SPLUNC1在β2和β3之間存在一個非常保守的發(fā)夾結(jié)構(gòu),這個發(fā)夾結(jié)構(gòu)
3、可以通過側(cè)鏈與C末端肽鏈之間形成氫鍵,將C末端錨定在α1和β2之間。在SPLUNC1的分子內(nèi)部存在兩個疏水腔,SPLUNC1應該使用靠近α4的疏水腔來結(jié)合LPS分子。SPLUNC3A截短了N末端24個殘基,無法結(jié)合LPS分子,也不具有抑菌功能。根據(jù)同源結(jié)構(gòu)比對,我們推測SPLUNC1通過N末端構(gòu)象變化打開輸水通道,暴露內(nèi)部疏水腔,用以結(jié)合LPS分子。在SPLUNC1的表面,電荷均勻分布,我們沒有找到大片的疏水區(qū)來解釋SPLUNC1的低溶
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