細胞周期調(diào)控蛋白cyclin D1基因靶向microRNAs的預(yù)測、系統(tǒng)驗證及西洋參提取物處理人乳腺癌細胞的表達譜分析.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、本論文的研究分兩個部分。第一階段基本圍繞害蟲生防真菌遺傳轉(zhuǎn)化體系的關(guān)鍵因素開展研究,目的是優(yōu)化球孢白僵菌芽生孢子轉(zhuǎn)化體系,提高轉(zhuǎn)化效率,以服務(wù)于生防真菌的基因操作和菌種(株)的分子定向選育。第二階段的工作是執(zhí)行教育部的博士研究生交流計劃,在美國南伊利諾斯大學開展合作研究,由美國的合作導(dǎo)師莫寅元副教授安排從事腫瘤發(fā)生發(fā)展microRNA(miRNA)調(diào)控機制研究,開展了miRNA靶基因搜索與驗證、miRNA表達譜分析兩方面的工作。主要結(jié)果

2、如下:
   CCND1基因靶向miRNA的預(yù)測與雙熒光素酶報告基因系統(tǒng)驗證基于miranda軟件(http://www.microRNA.org)的預(yù)測,克隆到58種pre-miRNA中的51種CCND1基因靶向miRNA,通過表達載體構(gòu)建(pCDH-CMV-MCS-EFl-copGFP)和真核細胞表達,經(jīng)實時熒光定量RT-PCR檢測,發(fā)現(xiàn)其中的45種pre-miRNA的表達水平相對較高。7種miRNA可使雙熒光素酶報告基因系

3、統(tǒng)中熒光素酶相對活性下將35%以上,顯示miranda軟件預(yù)測結(jié)果的陽性率約為16%。在7種可下調(diào)熒光素酶表達的miRNA中,miR-16、miR-34a、miR-195和miR-424a對CCND1基因的沉默作用已見報道,而miR-19a、miR-155和miR-503為首次發(fā)現(xiàn)。比較miRanda、TargetScan和PicTar軟件預(yù)測的CCND1基因靶向miRNA,三種軟件預(yù)測結(jié)果的交集陽性率最高,但僅由miRanda軟件預(yù)測

4、的miRNA中仍存在可能的靶向miRNA,突出了對其進行實驗驗證的必要性。預(yù)測結(jié)果的較低陽性率,揭示了miRNA/mRNA相互作用的復(fù)雜性。
   CCNDI基因靶向miRNA的系統(tǒng)驗證應(yīng)用Western雜交和實時熒光定量RT-PCR檢測雙熒光素酶報告基因系統(tǒng)篩選到的3種CCND1基因靶向miRNA(miR-19a,miR-155和miR-503)對人頭頸部腫瘤細胞UMSCC10B表達CCND1蛋白和mRNA的影響。結(jié)果顯示,m

5、iR-503在UMSCC10B細胞中可顯著降低CCND1蛋白和mRNA的表達。為了驗證miR-503沉默CCND1基因的特異性,使用anti-miR-503和熒光素酶報告基因載體共轉(zhuǎn)染人胚腎細胞293T,結(jié)果導(dǎo)致熒光素酶相對活性顯著上升,與miR-503轉(zhuǎn)染時相反。兩個miR-503預(yù)測靶位點被敲除后,雙熒光素酶報告基因系統(tǒng)檢測未見相對熒光素酶活性的明顯變化。這證明miR-503可通過與這兩個位點的特異結(jié)合沉默CCND1基因。而且,mi

6、R-503可在UMSCCIOB細胞中降低S期細胞比例和抑制細胞生長,故推測miR-503可能為抑癌基因。
   西洋參提取物處理人乳腺癌細胞的miRNA表達譜分析用0.5、0.75和1.0 mg/mL西洋參提取物分別處理MDA-MB-231人乳腺癌細胞,在不同時間點觀察可見細胞形態(tài)發(fā)生較明顯的改變,表現(xiàn)為細胞皺縮,胞質(zhì)粗糙。從0.5 mg/mL西洋參提取物處理24h后的樣品和對照樣品中提取總RNA,逆轉(zhuǎn)錄用于實時熒光定量PCR陣

7、列。在檢測的95種腫瘤相關(guān)miRNA中,發(fā)現(xiàn)miR-145和miR-205的表達分別上調(diào)3.2倍和4.5倍,miR-196a的表達下調(diào)82%。
   限制性內(nèi)切酶介導(dǎo)法和電擊法優(yōu)化球孢白僵菌芽生孢子轉(zhuǎn)化體系采用限制性內(nèi)切酶介導(dǎo)整合(REMI)和電擊法優(yōu)化球孢白僵菌芽生孢子轉(zhuǎn)化體系。在薩氏培養(yǎng)液中振蕩培養(yǎng)48h后轉(zhuǎn)到合成培養(yǎng)基GM(w/v:4%葡萄糖、0.4% NH4N03、0.3% KH2P04和0.3% MgS04)中培養(yǎng)_<

8、24 h,所獲芽生孢子用100 UHindlII或XbaI介導(dǎo)含草丁膦(PPT)抗性基因bar的1ug質(zhì)粒,具有良好的轉(zhuǎn)化效果。同樣孢齡的芽生孢子也適合電擊轉(zhuǎn)化,電場強度優(yōu)化為10 kV/cm。優(yōu)化的REMI法和電擊法可使轉(zhuǎn)化效率分別提高至38.5(±4.4)和52.7(±4.8)個轉(zhuǎn)化子/ug DNA,而對照PEG法的轉(zhuǎn)化效率僅為22.2(+1.7)個轉(zhuǎn)化子/ug DNA,轉(zhuǎn)化效率提高了73%和137%。轉(zhuǎn)化子經(jīng)連續(xù)三代無選擇壓培養(yǎng)后

9、仍能在400 ug/mL PPT的察氏培養(yǎng)基平板上生長,而親本菌株未見抗性。PCR反應(yīng)和Southern雜交鑒定隨機選取的10個REMI和電擊轉(zhuǎn)化子,目的基因均成功插入其基因組中。
   綜上所述,本研究的主要成果和創(chuàng)新點,一是系統(tǒng)驗證了CCND1基因靶向miRNA,篩選出特異性沉默CCND1基因的miRNA-503,推測其為抑癌基因;二是通過實時熒光定量PCR陣列檢測到西洋參提取物誘導(dǎo)的miR-145、miR-205和miR-

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