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文檔簡介
1、目的:篩選分析喉癌及對應的癌旁組織的長鏈非編碼RNA(LncRNA)的表達差異性,探究差異表達的LncRNA的臨床意義,為尋找喉癌新型診斷指標以及治療的改善提供新線索。
方法:利用基因芯片技術檢測6對喉癌及相對應的癌旁組織中LncRNA的差異表達情況,構建Incrna的差異表達譜,利用生物信息學手段對差異表達的LncRNA進行分析,篩選出具有顯著表達差異(Fc>2.0,P≤0.05)的LncRNA,再利用實時熒光定量PCR技術
2、驗證在38對喉癌以及相對應的癌旁組織中驗證芯片結果中部分具有顯著差異表達的LncRNA(NR_024065.2、TCONS_00010350、ENST00000438554.1、ENST00000434656.1),以進一步驗證基因芯片實驗結果,并將其表達與臨床病理特征相結合,尋找4個差異表達的LncRNA與臨床病理特征的關系。
結果:6對喉癌及相對應癌旁組織相比,有4477個差異表達的LncRNA,其中有748個LncRNA
3、表達上調和3729個LncRNA表達下調。選擇4個差異表達的LncRNA: NR_024065.2、TCONS_00010350、ENST00000438554.1、ENST00000434656.1進一步擴大樣本量進行驗證,結果顯示在38對喉癌及相對應癌旁組織中NR_024065.2、TCONS_00010350、ENST00000438554.1、ENST00000434656.1具有差異表達(P值分別為0.0202、0.0384、
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