胰腺導管腺癌中長鏈非編碼RNA生物信息學分析及l(fā)ncRNA n407201的預后相關(guān)性研究.pdf

1、長鏈非編碼RNA(long noncoding RNA，lncRNA)是一類超過200核苷酸單位的RNA分子，它們并不具有蛋白編碼功能，而是在多種層面上（表觀遺傳調(diào)控、轉(zhuǎn)錄調(diào)控以及轉(zhuǎn)錄后調(diào)控等）調(diào)控基因的表達水平以及參與疾病的發(fā)生發(fā)展。近年來研究報道多種腫瘤中存在lncRNA的異常表達，表明其在腫瘤的病理生理過程中可能扮演著重要角色。
　　為了探索胰腺導管腺癌(Pancreatic Ductal Adenocarcinoma，PD

2、AC)中l(wèi)ncRNA表達譜及其與microRNA、蛋白編碼RNA(Messenger RNA，mRNA)間的相互作用，本研究通過基因芯片技術(shù)在人PDAC及相應癌旁組織中檢測lncRNA、microRNA及mRNA差異表達譜，分析三者間復雜的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)，并從中篩選潛在的內(nèi)源競爭性RNA(competingendogenous RNAs，ceRNA)。此外，通過實時熒光定量聚合酶鏈式反應(Real-time Quantitative PCR，

3、qRT-PCR)分析27對胰腺導管腺癌及相應癌旁組織中5lncRNA的表達量。同時，應用統(tǒng)計學方法研究lncRNAn407201表達水平與PDAC患者臨床病理特征及預后的相關(guān)性。
　　芯片實驗數(shù)據(jù)結(jié)果顯示，與癌旁組織對比，共有570lncRNAs、47microRNA及1409mRNA在PDAC組織中異常表達(變化倍數(shù)≥2，P＜0.05，F(xiàn)DR＜0.05)。生物信息學分析顯示，lncRNA、microRNA及mRNA三者之間存在復

4、雜的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。qRT-PCR結(jié)果顯示lncRNAn407201在17/27位患者癌組織中表達水平顯著上調(diào)。此外，lncRNAn407201高表達與腫瘤最大直徑、CA199水平呈正相關(guān)(P＜0.05)，而與組織學分化水平呈負相關(guān)(P＜0.05)。Kaplan-Meier生存分析結(jié)果顯示lncRNAn407201高表達患者的預后顯著差于低表達者，同時Cox比例風險回歸模型結(jié)果顯示n407201高表達是患者預后的獨立危險因素?？傊?，本研究結(jié)果