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文檔簡介
1、單分子檢測(Single Molecule Detection,SMD)可以在單分子水平上對生物分子的構(gòu)象變化、動力學、分子之間相互作用以及對單個分子的操縱進行研究。與傳統(tǒng)分析方法只能提供復雜體系參數(shù)的平均值相比,SMD能探測到處于非平衡態(tài)下的個體行為和平衡狀態(tài)下體系的漲落,追蹤掩蓋在平衡狀態(tài)下的微觀動力學變化過程。此外,SMD不要求隨時間變化過程中的大量分子的狀態(tài)保持同步,且能捕捉到被宏觀觀測所淹沒的極少數(shù)的中間體或過渡狀態(tài)。
2、 生物大分子在液-固界面的行為研究有十分重要的意義,例如在生物芯片、生物傳感器等領域中,常需要研究生物分子在基底的非特異性吸附。利用單分子檢測技術(shù)研究生物大分子在液-固界面的吸附、解吸附的詳細動力學過程,對于研究生物傳感器的設計、色譜和毛細管電泳過程中的基底選擇等方向有重要意義。故本論文應用單分子熒光成像技術(shù)研究了YOYO-1標記的DNA分子在液-固界面的單分子行為。具體內(nèi)容如下: (1)圖像處理是單分子實驗中非常重要的一部分,
3、直接影響數(shù)據(jù)的準確性和整個實驗結(jié)果。針對本實驗的研究對象--DNA分子,當熒光照片上DNA分子數(shù)較少時,人工計數(shù)并非很復雜,但當DNA分子總數(shù)很多時,人工計數(shù)的工程量則較大,浪費工作者很多時間,此時利用Image J軟件的自動計數(shù)功能則能快速、準確的得到結(jié)果,因此很有必要對Image J軟件在單分子熒光成像中的應用進行研究。而在利用Image J軟件分析和優(yōu)化其熒光照片時,閾值、滾動球半徑和單個DNA分子的平均最小占據(jù)的像素值的設置非常
4、重要,因此,論文針對本實驗中所獲取的DNA單分子圖像的特點,利用Image J軟件找到了適用于本實驗中的DNA分子的扣除背景,快速計算吸附及未吸附的DNA分子個數(shù),獲取單個。DNA分子的動力學行為,測量熒光強度等圖像解析操作的最佳參數(shù)等,而在此最佳參數(shù)下得到的DNA分子總數(shù)與人工計數(shù)的結(jié)果基本一致,數(shù)據(jù)準確可靠。 (2)應用全內(nèi)反射熒光顯微鏡,利用YOYO-1標記的λ-DNA分子作為探針研究了三種不同硅烷化試劑修飾的蓋玻片表面的
5、性質(zhì),在不同的pH值下,考察pH值對單個DNA在這三種不同表面行為(自由運動和吸附)的影響,并應用接觸角(Contact Angle,CA)表征了這三個不同表面的性質(zhì)。實驗表明,在3-巰丙基三甲氧基硅烷((3-mercaptopropyl)trimethoxysilane,3-MPTS)和正辛基三乙氧基硅烷(n-Octyltriethoxysilane,OTES)修飾的表面,在pH=8.20時,DNA分子全部自由運動,隨著pH值的降低,
6、DNA吸附率隨之增大,根據(jù)接觸角(CA)表征結(jié)果,這兩個表面是親水表面,但是用3-MPTS修飾的蓋玻片表面更親水。然而利用三乙氧基(3,3,4,4,5,5,6,6,7,7,8,8,8-十三氟辛基)硅烷(1H,1H,2H,2H-Perfluorooctyltriethoxysilane,PFOTES)修飾的表面是疏水的,在pH=8.20時,個別DNA分子已經(jīng)吸附在其表面,隨著pH值的降低,DNA在其表面的吸附率也逐漸增大。在相同pH值下,
7、DNA分子在三種硅烷化試劑修飾的蓋玻片表面的吸附率區(qū)別比較明顯,其順序依次為3-MPTS 8、微鏡(Atomic Force Microscope,AFM)表征了SiO2納米粒子薄膜表面的性質(zhì)。實驗表明,隨著pH值的降低,DNA分子在其表面的吸附率隨之增大。DNA分子在SiO2納米粒子薄膜表面的吸附行為是靜電作用和疏水作用共同作用的結(jié)果,但是起主導作用的是疏水作用。此外,相同pH值下,與文獻中報道的DNA在玻片上的吸附率相比,DNA在SiO2納米粒子薄膜表面的吸附率要大的多,這是由于SiO2納米粒子的比表面積大,表面活性位點多,
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