分子信標(biāo)技術(shù)在生物酶和ATP等重要生物分子檢測(cè)中的應(yīng)用.pdf_第1頁
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1、生物酶和ATP等重要生物分子是生物體和生命現(xiàn)象的結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)和功能基礎(chǔ),在物質(zhì)代謝、機(jī)體防御、血液凝固、肌肉收縮、細(xì)胞信息傳遞、個(gè)體生長(zhǎng)發(fā)育、組織修復(fù)等方面發(fā)揮著不可替代的重要作用,它們的含量和活性直接關(guān)系到生物體的健康。因此,深入研究這些生物分子之間的相互作用,特別是建立這些生物分子快速、簡(jiǎn)便、準(zhǔn)確、靈敏的分析方法,對(duì)分子水平上闡明生命的奧秘、新型藥物的開發(fā),攻克許多疑難病癥以及促進(jìn)信息科學(xué)的發(fā)展都有重要的意義,是當(dāng)前生物分析化學(xué)研究的前

2、沿和熱點(diǎn)。 本論文以上述科學(xué)問題為目標(biāo),結(jié)合當(dāng)前發(fā)展的核酸探針技術(shù)和分子生物學(xué)手段,巧妙地利用了核酸酶(連接酶或聚合酶)、核酸以及分子信標(biāo)核酸探針的特殊性質(zhì),發(fā)展了激酶、磷酸酶和限制性內(nèi)切酶等生物酶活性實(shí)時(shí)檢測(cè)的新方法。更重要的是,首次將分子信標(biāo)探針用于三磷酸腺苷(ATP)、煙酰胺腺嘌呤二核苷酸(NAD)、煙酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸(NADP)等重要生物小分子的檢測(cè)。主要內(nèi)容歸納如下: 首先,拓展了NTFS平臺(tái)技術(shù)的應(yīng)用,

3、將其用于ATP、NAD、NADP、肌酸激酶、蛋白激酶等重要生物分子的檢測(cè),具體包括以下六個(gè)部分: 1、分子信標(biāo)技術(shù)結(jié)合T4 DNA連接酶用于ATP的檢測(cè)。利用T4 DNA連接酶對(duì)ATP的高度依賴性,我們發(fā)展了一種ATP檢測(cè)新方法。在ATP存在的條件下,T4 DNA連接酶以分子信標(biāo)為模板,將兩段短核酸片段連接,連接產(chǎn)物將分子信標(biāo)打開,熒光信號(hào)增強(qiáng),從而達(dá)到檢測(cè)ATP的目的。該方法靈敏,簡(jiǎn)單,其線性響應(yīng)范圍為1~300 nM,檢測(cè)下

4、限為0.14 nM。并利用該方法對(duì)細(xì)胞內(nèi)的ATP水平進(jìn)行了初步分析。 2、分子信標(biāo)技術(shù)用于肌酸激酶活性的檢測(cè)。二磷酸腺苷(ADP)與磷酸肌酸在肌酸激酶催化作用下生成肌酸和ATP,由于T4 DNA連接酶對(duì)ATP的高度依賴性,T4 DNA連接酶就會(huì)識(shí)別并利用生成的ATP進(jìn)行DNA連接反應(yīng),產(chǎn)生的長(zhǎng)鏈DNA將分子信標(biāo)打開,使熒光信號(hào)增強(qiáng),達(dá)到檢測(cè)肌酸激酶活性的目的。其線性響應(yīng)范圍為1~50U/L,檢測(cè)下限為0.64U/L。并用此方法考

5、察了藥物對(duì)CK活性的影響。該方法快速、簡(jiǎn)便、靈敏度高。 3、分子信標(biāo)技術(shù)用于蛋白激酶A活性的檢測(cè)。以蛋白激酶A為模型,通過測(cè)定蛋白激酶催化后所剩余的ATP的量來檢測(cè)蛋白激酶的活性。T4 DNA連接酶和分子信標(biāo)底物被用于ATP的檢測(cè),其線性響應(yīng)范圍為12.5~150 nM,檢測(cè)下限為1.25 nM。并考察了藥物染料木素對(duì)蛋白激酶A的抑制作用。該方法不用進(jìn)行同位素標(biāo)記、操作簡(jiǎn)便、具有通用性。 4、分子信標(biāo)結(jié)合酶信號(hào)放大檢測(cè)A

6、TP。結(jié)合連接酶、腺苷酸激酶和核苷二磷酸激酶對(duì)ATP進(jìn)行了檢測(cè)。連接反應(yīng)消耗ATP生成單磷酸腺苷(AMP),AMP與三磷酸脫氧胞苷酸(dCTP)在腺苷酸激酶的催化下生成ADP和2-脫氧胞苷5-二磷酸(dCDP),ADP和dCTP在核苷二磷酸激酶催化下生成ATP,使得ATP得到循環(huán)。利用T4 DNA連接酶對(duì)ATP的高度依賴性,ATP的不斷產(chǎn)生使得被打開的分子信標(biāo)不斷增加,檢測(cè)的線性范圍為0.01~10 nM,檢測(cè)下限為5 pM,與最靈敏的

7、ATP檢測(cè)方法生物發(fā)光法的靈敏度相當(dāng)。 5、基于分子信標(biāo)的NAD高靈敏檢測(cè)方法。本章利用大腸桿菌DNA連接酶對(duì)NAD的高度依賴性,發(fā)展了一種NAD檢測(cè)新方法。在NAD存在的條件下,大腸桿菌DNA連接酶被激活,并以分子信標(biāo)為模板,將兩段短核酸片段連接,連接產(chǎn)物將分子信標(biāo)打開,熒光信號(hào)增強(qiáng),從而達(dá)到檢測(cè)NAD的目的。該方法靈敏,簡(jiǎn)單,其線性范圍為0.3~40nM及40~300 nM,檢測(cè)下限為0.3 nM。并利用該方法考察了卡路里限制對(duì)MC

8、F7細(xì)胞內(nèi)NAD水平的影響。 6、基于分子信標(biāo)的NADP高靈敏檢測(cè)方法。首先利用堿性磷酸酶將NADP的磷酸根切除轉(zhuǎn)化生成NAD,然后將NAD加入到分子信標(biāo)及大腸桿菌DNA連接酶連接體系中進(jìn)行檢測(cè),通過記錄并計(jì)算熒光增強(qiáng)的初速度來定量,檢測(cè)的線性范圍為5~200 nM,檢測(cè)下限為2 nM。這是一種簡(jiǎn)單、快速、高靈敏度的NADP分析新方法,且具有良好的特異性。 其次,對(duì)NTFS平臺(tái)技術(shù)進(jìn)行了改進(jìn),基于聚合酶延伸反應(yīng)發(fā)展了一種

9、更簡(jiǎn)便快速的用于實(shí)時(shí)研究核酸與蛋白質(zhì)(酶)相互作用的新技術(shù),主要包括以下四個(gè)部分: 7、分子信標(biāo)用于DNA聚合酶活性的實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)。研究聚合酶活性的傳統(tǒng)方法主要是放射性同位素標(biāo)記結(jié)合凝膠電泳,操作復(fù)雜費(fèi)時(shí),并且不能提供實(shí)時(shí)信息。本章利用分子信標(biāo)技術(shù),建立了一種簡(jiǎn)單、快速、靈敏地實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)聚合酶活性的方法。其線性響應(yīng)范圍為0.003~6.25 U/mL,檢測(cè)下限為0.003 U/mL。并探討了聚合酶抑制劑對(duì)酶活性的影響,為以聚合酶為作用

10、靶標(biāo)的新藥開發(fā)及篩選提供了一種新的思路。 8、分子信標(biāo)用于核酸3’端去磷酸化過程的實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)。利用分子信標(biāo)技術(shù),結(jié)合DNA聚合酶發(fā)展了一種核酸3’端去磷酸化實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)方法,建立了T4多聚核苷酸激酶(T4 PNK)的酯酶活性分析新方法。其線性響應(yīng)范圍為0.1~15 U/mL,檢測(cè)下限為0.1 U/mL。并探討了酶抑制劑對(duì)T4 PNK酯酶活性的影響,為T4 PNK抑制劑篩選提供了新的思路和方法。 9、分子信標(biāo)用于限制性內(nèi)切酶活性

11、的實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)。傳統(tǒng)的檢測(cè)限制性內(nèi)切酶活性的方法是不連續(xù)的,費(fèi)時(shí)的。本章利用分子信標(biāo)技術(shù),建立了一種簡(jiǎn)便快捷、靈敏地連續(xù)監(jiān)測(cè)限制性內(nèi)切酶活性的方法。其線性響應(yīng)范圍為1~250 U/mL,檢測(cè)下限為1U/mL。并探討了限制性內(nèi)切酶抑制劑對(duì)酶活性的影響,為以限制性內(nèi)切酶為作用靶標(biāo)的新藥開發(fā)及篩選提供了新的手段。 10、分子信標(biāo)用于堿性磷酸酶活性的分析。利用分子信標(biāo)技術(shù),建立了一種簡(jiǎn)單、快速、靈敏地監(jiān)測(cè)磷酸酶活性的新方法,首次利用DNA作

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