二倍體亞洲棉gossypiumarboreuml.遺傳圖譜的構(gòu)建及產(chǎn)量、品質(zhì)qtl分析

1、南京農(nóng)業(yè)大學(xué)博士學(xué)位論文二倍體亞洲棉（Gossypium arboreum L.）遺傳圖譜的構(gòu)建及產(chǎn)量、品質(zhì)QTL分析姓名：馬雪霞申請(qǐng)學(xué)位級(jí)別：博士專(zhuān)業(yè)：作物遺傳育種指導(dǎo)教師：張?zhí)煺?0071101博士學(xué)位論文二倍體亞洲棉遺傳圖譜的構(gòu)建及產(chǎn)量、品質(zhì)O T L 分析用的親本、F 1 及F 2 群體單株的D N A 模板進(jìn)行兩重P C R 探索、分析；另外，在擴(kuò)增產(chǎn)物的電泳檢測(cè)時(shí)，結(jié)合銀染技術(shù)，試驗(yàn)了單一引物P C R 擴(kuò)增產(chǎn)物在同一泳道同

2、時(shí)上樣和先后分時(shí)上樣的兩重檢測(cè)方法，以期對(duì)兩重檢測(cè)方法對(duì)多態(tài)性位點(diǎn)檢測(cè)的效果進(jìn)行評(píng)價(jià)．結(jié)果表明，即使采用與單一引物P C R 相同的反應(yīng)體系，兩重P C R 擴(kuò)增也可獲得與之相同的多態(tài)性產(chǎn)物；而兩重檢測(cè)法的結(jié)果亦顯示出與相應(yīng)的單引物檢測(cè)到的相應(yīng)的多態(tài)性位點(diǎn)，能準(zhǔn)確反映單引物所能達(dá)到的檢測(cè)效果，因而為S S R 的多重P C R 和擴(kuò)增后多重檢測(cè)的技術(shù)在高效的遺傳圖譜構(gòu)建工作中進(jìn)一步應(yīng)用提供實(shí)驗(yàn)依據(jù)．2 ．亞洲棉種內(nèi)遺傳圖譜的構(gòu)建從6 0

3、 9 2 對(duì)S S R 引物中篩選到2 6 8 對(duì)引物( 4 ．4 0 ％) 在雙親間表現(xiàn)多態(tài)，得到3 2 0個(gè)多態(tài)位點(diǎn)．其中1 7 4 對(duì)( 6 4 ．9 3 ％) 為E S T - S S R s ，9 4 對(duì)來(lái)自亞洲棉纖維E S T - S S R s引物，4 1 對(duì)來(lái)自陸地棉纖維和胚珠E S T - S S R s ，3 9 對(duì)來(lái)自雷蒙德氏棉真葉和纖維的E S T - S S R s ，多態(tài)率分別為6 ．8 2 ％、2 ．9 9

4、 ％、2 ．5 1 ％。3 2 0 個(gè)位點(diǎn)中共有2 4 7 個(gè)位點(diǎn)( 4 2 ．9 1 ％) 為顯性標(biāo)記，其中1 1 5 個(gè)位點(diǎn)( 3 5 ％) 為江陵中棉顯性帶，1 3 2 ( 4 9 ．2 5 ％) 個(gè)位點(diǎn)為浙江蕭山綠樹(shù)顯性帶．共有8 4 個(gè)顯性位點(diǎn)和8 個(gè)共顯性位點(diǎn)( 2 8 ．7 5 ％) 偏分離。采用J o i n M a p 4 ．0 作圖軟件進(jìn)行分子標(biāo)記的連鎖分析，其中2 6 7 個(gè)位點(diǎn)包括三個(gè)形態(tài)標(biāo)記構(gòu)建到1 3 個(gè)連鎖

5、群上．圖譜總長(zhǎng)2 5 0 8 ．7 1 ，標(biāo)記間平均遺傳距離為9 ．4 c M ，所有的標(biāo)記均勻分布在連鎖群上，沒(méi)有聚集現(xiàn)象，其中6 7 個(gè)偏分離位點(diǎn)整合到連鎖群，在連鎖群L G A 2 、A 4 、A 6 、A 7 、A 1 0 、A l l 、A 1 3 分布較多，且有聚集現(xiàn)象。參照本實(shí)驗(yàn)室建立的海陸種間遺傳連鎖圖譜，8 9 個(gè)共同的標(biāo)記將連鎖群定位到相應(yīng)的染色體上．共同的標(biāo)記中有4 9 個(gè)分布在染色體A t 亞組，4 0 個(gè)在D

6、t 亞組。同源位點(diǎn)的比較表明二倍體和四倍體同源染色體大部分存在共線性，同時(shí)伴隨倒位現(xiàn)象．二倍體重復(fù)位點(diǎn)表明亞洲棉可能是古老的多倍體，染色體1 、2 和3 ，4 和5 可能是同源染色體，但由于與四倍體共有的位點(diǎn)太少，沒(méi)有觀察到與四倍體間易位的確切位點(diǎn)．利用B L A S T 分析對(duì)多態(tài)的基因組S S R 和E S T - S S R 進(jìn)行了功能相似性分析，共有1 4個(gè)基因組S S R 和1 0 0 個(gè)E S T - S S R 具有催化、