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1、利用SeqMan進(jìn)行序列拼接Step1:Step1:打開打開SeqmanSeqman軟件軟件Step2:Step2:加入你要拼接的序列加入你要拼接的序列點(diǎn)擊Addsequences查找并選中要拼接的序列(可按住control鍵進(jìn)行多選)點(diǎn)擊Add按鈕填加選擇的序列填加完后點(diǎn)擊done注:最好用測(cè)序的圖譜盡量不要直接用測(cè)序得到的序列Step3:Step3:去除末端序列去除末端序列主要是去除序列末端測(cè)序質(zhì)量差或是載體序列有兩種方法可以用來(lái)去
2、除這類末端序列其一:利用Seqman自帶的去除工具自動(dòng)去除(利用Trimends按鈕進(jìn)行)其二:手工去除個(gè)人感覺手工去除方法最有效,因此下邊我們以后工去除為例進(jìn)行演示手工去除側(cè)翼序列雙擊要去除側(cè)翼序列的目標(biāo)序列將鼠標(biāo)放到測(cè)序圖譜左邊的一個(gè)黑色的豎線上,此時(shí)鼠標(biāo)會(huì)變成一個(gè)有兩個(gè)箭頭的水平線按住左鍵拖動(dòng)黑豎線,那么你就會(huì)發(fā)現(xiàn)側(cè)翼序列的顏色變淺,這部分變淺的序列則就被去除,不再參加后面的拼接Step4:Step4:進(jìn)行序列拼接進(jìn)行序列拼接點(diǎn)擊
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