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1、第二章第二章蛋白質(zhì)蛋白質(zhì)蛋白質(zhì)蛋白質(zhì):由許多不同的α氨基酸按一定的序列通過(guò)酰胺鍵(肽鍵)縮合而成的,具有較穩(wěn)定構(gòu)象和特定生物功能的生物大分子。蛋白質(zhì)存在于所有的生物細(xì)胞中,是構(gòu)成生物體最基本的結(jié)構(gòu)物質(zhì)和功能物質(zhì)。蛋白質(zhì)是生命活動(dòng)的物質(zhì)基礎(chǔ),它參與了幾乎所有的生命活動(dòng)過(guò)程。一、蛋白質(zhì)的分類一、蛋白質(zhì)的分類1、組成、組成:?jiǎn)渭兊鞍踪|(zhì);結(jié)合蛋白質(zhì)2、形狀、形狀:纖維狀蛋白質(zhì):球狀蛋白質(zhì);膜蛋白質(zhì)3、功能、功能:酶;調(diào)節(jié)蛋白;儲(chǔ)存蛋白;轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白
2、;運(yùn)動(dòng)蛋白;防御蛋白與毒蛋白;受體蛋白;支架蛋白;結(jié)構(gòu)蛋白;異常功能蛋白二、蛋白質(zhì)的組成單位二、蛋白質(zhì)的組成單位——氨基酸氨基酸1、元素組成、元素組成:CHONS,蛋白質(zhì)系數(shù)6.252、氨基酸組成、氨基酸組成:①氨基酸(aminoacid):分子中既含氨基又含羧基的化合物,蛋白質(zhì)中僅含有20(2)種基本氨基酸。②氨基酸的結(jié)構(gòu)通式:α-氨基酸的結(jié)構(gòu)通式(除脯氨酸外,均為α氨基酸)3、氨基酸的光學(xué)活性和立體化學(xué)特性、氨基酸的光學(xué)活性和立體化
3、學(xué)特性①α-氨基酸的α-碳是一個(gè)不對(duì)稱原子(手性碳原子),α-氨基酸是光活性物質(zhì)(甘氨酸除外)。②除甘氨酸外,其它19種基本氨基酸至少有兩種異構(gòu)體;具有兩個(gè)不對(duì)稱碳原子的氨基酸(例如蘇氨酸、異亮氨酸)可以有4種異構(gòu)體;構(gòu)成蛋白質(zhì)的氨基酸(除脯氨酸和甘氨酸外)均為L(zhǎng)型氨基酸;蛋白質(zhì)用堿進(jìn)行水解時(shí),或用一般的有機(jī)合成方法合成氨基酸時(shí),得到的氨基酸為D型氨基酸和L型氨基酸的混合物。4、氨基酸的分類(、氨基酸的分類(20種基本氨基酸)①根據(jù)人體
4、需要:必需氨基酸;版必需氨基酸;非必需氨基酸。②根據(jù)R基團(tuán)的化學(xué)結(jié)構(gòu):脂肪族氨基酸;芳香族氨基酸;雜環(huán)氨基酸。③根據(jù)R基團(tuán)的極性和帶電性質(zhì):非極性氨基酸;極性氨基酸(不帶電,帶正電,帶負(fù)電)。④不常見(jiàn)的蛋白質(zhì)氨基酸,非蛋白質(zhì)氨基酸。5、氨基酸的理化性質(zhì)、氨基酸的理化性質(zhì)①1)一般物理性質(zhì);2)旋光性;3)紫外吸收光譜和熒光光譜②兩性解離和等電點(diǎn):1)兩性解離;2)氨基酸的解離;3)等電點(diǎn)③氨基酸的化學(xué)性質(zhì):1)?-氨基參加的反應(yīng);2)?
5、-羧基參加的反應(yīng);3)?-氨基和?-羧基共同參加的反應(yīng);4)側(cè)鏈R基參加的反應(yīng)6、氨基酸的生理功能、氨基酸的生理功能三、肽三、肽1、肽、肽:一個(gè)氨基酸的氨基與另一個(gè)氨基酸的羧基之間失水所形成的化合物。組成肽的氨基酸單元稱為氨基酸殘基。2、肽的命名、肽的命名:不多于12個(gè)殘基的肽直接稱為二肽、三肽……;超過(guò)12個(gè)而不多于20個(gè)殘基的肽稱為寡肽;20個(gè)(含20個(gè))以上殘基的肽稱為多肽。3、肽鍵、肽鍵5、超二級(jí)結(jié)構(gòu)和結(jié)構(gòu)域、超二級(jí)結(jié)構(gòu)和結(jié)構(gòu)域
6、(1)定義:超二級(jí)結(jié)構(gòu)和結(jié)構(gòu)域是位于二級(jí)結(jié)構(gòu)和三級(jí)結(jié)構(gòu)之間的兩個(gè)層次,超二級(jí)結(jié)構(gòu)的層次接近二級(jí)結(jié)構(gòu),而結(jié)構(gòu)域的層次接近三級(jí)結(jié)構(gòu)。(2)①超二級(jí)結(jié)構(gòu):相鄰的二級(jí)結(jié)構(gòu)元件組合在一起,彼此相互作用,形成有規(guī)則的在空間上能辨認(rèn)的二級(jí)結(jié)構(gòu)組合或二級(jí)結(jié)構(gòu)串,其充當(dāng)三級(jí)結(jié)構(gòu)的構(gòu)件。常見(jiàn)的超二級(jí)結(jié)構(gòu):1)αα(復(fù)繞α螺旋);2)βαβ;3)ββ(β曲折和希臘鑰匙拓?fù)浣Y(jié)構(gòu));4)β折疊桶;5)α螺旋β轉(zhuǎn)角α螺旋②結(jié)構(gòu)域:多肽鏈在二級(jí)結(jié)構(gòu)及超二級(jí)結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ)
7、上,進(jìn)一步卷曲折疊成的相對(duì)獨(dú)立的緊密球狀結(jié)構(gòu)。結(jié)構(gòu)域的類型:1)反平行?螺旋結(jié)構(gòu)域;2)反平行?折疊片結(jié)構(gòu)域;3)混合型折疊結(jié)構(gòu)域(??結(jié)構(gòu)域);4)富含金屬或二硫鍵結(jié)構(gòu)域6、蛋白質(zhì)的三級(jí)結(jié)構(gòu)、蛋白質(zhì)的三級(jí)結(jié)構(gòu)(1)定義:蛋白質(zhì)分子在二級(jí)結(jié)構(gòu)或超二級(jí)結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)上進(jìn)一步盤曲折疊而形成的整體構(gòu)象,也就是一條多肽鏈全部原子在三維空間的排布位置。(2)維系蛋白質(zhì)三級(jí)結(jié)構(gòu)的相關(guān)作用力:氫鍵、疏水作用、離子鍵和范德華力等。二硫鍵是維持三級(jí)結(jié)構(gòu)唯一的一
8、種共價(jià)鍵,能把肽鏈的不同區(qū)段牢固地連接在一起。(3)蛋白質(zhì)三級(jí)結(jié)構(gòu)的特點(diǎn):①許多在一級(jí)結(jié)構(gòu)上相差很遠(yuǎn)的,氨基酸殘基在三級(jí)結(jié)構(gòu)上相距很近;②三級(jí)結(jié)構(gòu)是蛋白質(zhì)發(fā)揮生物活性所必須的;③所有具有高度生物學(xué)活性的蛋白質(zhì)幾乎都是球狀蛋白;7、蛋白質(zhì)的四級(jí)結(jié)構(gòu)、蛋白質(zhì)的四級(jí)結(jié)構(gòu)(1)定義:專指亞基的種類、數(shù)量以及各個(gè)亞基在寡聚蛋白質(zhì)中的空間排布和亞基間的相互作用。(2)維持四級(jí)結(jié)構(gòu)的化學(xué)鍵(作用力):范德華力、氫鍵、離子鍵、疏水作用(亞基締合的驅(qū)動(dòng)力
9、)和二硫鍵。(3)四級(jí)結(jié)構(gòu)的特點(diǎn):①亞基單獨(dú)存在時(shí)無(wú)生物活性,只有相互聚合成特定構(gòu)象時(shí)才具有完整的生物活性;②當(dāng)酸、熱或高濃度的尿素胍等變性因子作用于寡聚蛋白時(shí),亞基彼此解離分開(kāi)、伸展成無(wú)規(guī)卷曲。如小心處理,可將寡聚體蛋白的亞基拆開(kāi),而不破壞其三級(jí)結(jié)構(gòu);③四級(jí)結(jié)構(gòu)的形成遵從“自我裝配”的原則。(4)四級(jí)結(jié)構(gòu)的對(duì)稱性:大多數(shù)寡聚蛋白質(zhì)分子的亞基的排列是對(duì)稱的:①環(huán)狀對(duì)稱,②二面體點(diǎn)群對(duì)稱,③二十面體點(diǎn)群對(duì)稱(5)四級(jí)締合在結(jié)構(gòu)和功能上的優(yōu)
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