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文檔簡介
1、促黃體素( luteinizing hormone, LH)是垂體前葉嗜堿性細(xì)胞合成分泌的糖蛋白激素,由α和β兩個(gè)亞基組成,是促使雌性卵泡成熟和排卵的重要激素。促性腺激素釋放激素( gonadotropin releasing hormone, GnRH)是下丘腦神經(jīng)內(nèi)分泌細(xì)胞合成的十肽,以脈沖形式釋放,刺激LH和FSH的合成與釋放,其功能的發(fā)揮依賴于促性腺激素釋放激素受體(gonadotropin releasing hormone
2、receptor, GnRHR)的作用。本試驗(yàn)采用PCR-SSCP技術(shù),將LHβ基因和GnRH基因作為目的基因,對湖羊、無角陶賽特羊、特克賽爾羊以及哈薩克羊共307只個(gè)體進(jìn)行多態(tài)性檢測,分析綿羊LHβ基因和GnRH基因第一、二外顯子的遺傳多樣性,并分析了各多態(tài)位點(diǎn)與綿羊生產(chǎn)繁殖性狀之間的關(guān)系,探討調(diào)控綿羊繁殖力的基因位點(diǎn),為湖羊的選育和保種提供理論基礎(chǔ)。在此基礎(chǔ)上,進(jìn)一步利用生物信息學(xué)軟件對LHβ基因和GnRH基因的氨基酸組成、序列的特
3、征進(jìn)行了分析,并進(jìn)行了結(jié)構(gòu)和功能的預(yù)測。研究結(jié)果如下:
1.綿羊LHβ基因和GnRH基因第一、第二外顯子的PCR-SSCP分析
對8個(gè)擴(kuò)增片斷進(jìn)行PCR-SSCP分析(LHβ,引物1-6;GnRH,引物7-8),在其中的5個(gè)擴(kuò)增片斷上發(fā)現(xiàn)了突變。其中,引物2擴(kuò)增片段中發(fā)現(xiàn)6種基因型(AA、AB、AC、BB、BC、BD);引物4擴(kuò)增片段中發(fā)現(xiàn)2種基因型(EE,EF);引物5擴(kuò)增片段中發(fā)現(xiàn)5種基因型(GG,GH,
4、HH,GI,GJ);引物7擴(kuò)增片段中發(fā)現(xiàn)3種基因型(AA,AB,CC);引物8擴(kuò)增片段中發(fā)現(xiàn)3種基因型(DD,DE,EE)。測序結(jié)果表明:LHβ5調(diào)控區(qū)發(fā)現(xiàn)4個(gè)多態(tài)性位點(diǎn)(286T→C、424A→G、439T→C、705G→A),在第二外顯子區(qū)發(fā)現(xiàn)2個(gè)多態(tài)性位點(diǎn)(1042bpC→G、1136C→T),其中1042bp處突變導(dǎo)致了甘氨酸→丙氨酸的改變。GnRH第一外顯子5’非翻譯區(qū)發(fā)生3處堿基突變(552T→G、653C→G、654G→A
5、);在第二外顯子區(qū)發(fā)生1處堿基突變(230G→C),導(dǎo)致了精氨酸→絲氨酸的改變。
2.LHβ基因和GnRH基因群體遺傳學(xué)分析及與綿羊生產(chǎn)繁殖性能的關(guān)系
群體遺傳學(xué)分析表明:對于片斷2,A為優(yōu)勢等位基因,在湖羊和無角陶賽特羊中發(fā)現(xiàn)除BC基因型以外的5種基因型;特克賽爾羊中發(fā)現(xiàn)BC基因型,但未發(fā)現(xiàn)BB、BD基因型,哈薩克羊只存在AA基因型。對于片段4,E為優(yōu)勢等位基因,除哈薩克羊只存在EE基因型外,湖羊、無角陶賽
6、特和特克賽爾羊均存在EE和EF2種基因型。引物5在湖羊中發(fā)現(xiàn)5種基因型(GG、GH、GI、GJ、HH),G為優(yōu)勢等位基因,在無角陶賽特羊中發(fā)現(xiàn)2種基因型(GG和GI),特克賽爾羊和單胎哈薩克羊只存在GG基因型。對于引物7擴(kuò)增片段,A為優(yōu)勢等位基因,只在哈薩克羊中檢測到CC基因型,但沒有發(fā)現(xiàn)AB基因型。對于引物8擴(kuò)增片段,在4個(gè)綿羊群體中,D為優(yōu)勢等位基因,在湖羊中同時(shí)存在DD、DE、EE三種基因型,哈薩克羊中沒有發(fā)現(xiàn)EE基因,無角陶賽特
7、和特克賽爾羊中沒有發(fā)現(xiàn)EE和DE基因型。
群體平衡檢測發(fā)現(xiàn),引物2擴(kuò)增片段中,湖羊和無角陶賽特羊的x2值達(dá)到顯著水平,偏離Hardy-Weinberg平衡(P<0.05)。在引物5擴(kuò)增片段中,特克賽爾羊的x2值達(dá)到顯著水平,偏離Hardy-Weinberg平衡(P<0.05)。
各多態(tài)位點(diǎn)與湖羊產(chǎn)羔數(shù)的最小二乘分析表明:對于片斷2,AB基因型產(chǎn)羔數(shù)最小二乘均值比AA基因型多0.45只(P<0.05);對于片斷
8、5,GJ基因型產(chǎn)羔數(shù)最小二乘均值比GG基因型多1.83只(P<0.05);引物2和引物5基因突變與產(chǎn)羔數(shù)成正相關(guān),對于片斷4、7、8,產(chǎn)羔數(shù)最小二乘均值在各基因型間沒有顯著差異.
運(yùn)用生物信息學(xué)軟件對LHβ基因和GnRH基因的氨基酸組成、亞細(xì)胞定位以及氨基酸序列的特征進(jìn)行了分析,并進(jìn)行了結(jié)構(gòu)和功能的預(yù)測。研究發(fā)現(xiàn)LHβ基因5,調(diào)控區(qū)突變(439,T→C;705,G→A)和GnRHR基因5’調(diào)控區(qū)突變(552,T→G)突變引
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