遼寧省東北林蛙遺傳多樣性與環(huán)渤海地區(qū)林蛙系統(tǒng)發(fā)育研究.pdf

1、運(yùn)用RAPD分子標(biāo)記方法，對(duì)分布于遼寧省的4個(gè)東北林蛙種群的遺傳多樣性進(jìn)行研究，以揭示遼寧省東北林蛙的遺傳多樣性水平、遺傳變異和遺傳結(jié)構(gòu)，進(jìn)而探討東北林蛙種群間的遺傳分化程度及其與其生境的關(guān)系，為合理利用東北林蛙資源提供科學(xué)的依據(jù)。通過(guò)對(duì)環(huán)渤海地區(qū)分布的林蛙線粒體16S rRNA基因序列分析，采用多種方法對(duì)其系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系進(jìn)行分析，探討本地區(qū)林蛙動(dòng)物的系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系和演化機(jī)制，以期為從分子生物地理學(xué)角度探索環(huán)渤海地理形成及變化的過(guò)程提供幫助

2、。
　　 一、從遼寧省桓仁、撫順、本溪和阜新采集到4個(gè)自然種群的東北林蛙，通過(guò)RAPD分子標(biāo)記，研究了東北林蛙的遺傳多樣性和遺傳分化。主要分析了種群間的等位基因頻率、多態(tài)條帶百分率(PPL)、基因多樣度(h)、基因分化系數(shù)(Gst)和Shannon多樣指數(shù)等遺傳參數(shù)，用非加權(quán)平均法構(gòu)建系統(tǒng)樹(shù)，并通過(guò)分子變異分析(AMOVA)來(lái)探討遺傳變異在個(gè)體、種群和地理區(qū)域等不同階層中的分布格局。研究結(jié)果如下：
　　 (1)從23個(gè)隨

3、機(jī)引物中篩選出9個(gè)重復(fù)性好、多態(tài)性高的引物，對(duì)110個(gè)東北林蛙樣本基因組DNA進(jìn)行擴(kuò)增，每個(gè)引物擴(kuò)增出7-13個(gè)明顯的片斷，共檢出95條帶，全部表現(xiàn)出多態(tài)性，多態(tài)百分率100％。Shnnaon多樣指數(shù)(I=0.1596)及Nei基因多樣性指數(shù)(h=0.0821)均顯示東北林蛙遺傳變異程度比較低，遺傳多樣性相對(duì)缺乏。表現(xiàn)最為豐富的桓仁地區(qū)，Shannon多樣指數(shù)也僅為0.2337，基因多樣性指數(shù)為0.1341。
　　 (2)4個(gè)地

4、理種群間基因分化系數(shù)(Gst=0.0231)較低，而群體之間每代遷移數(shù)很大(Nm=9.0219)，說(shuō)明各群體間基因交流比較多，群體之間無(wú)顯著遺傳分化。在基因多樣性測(cè)度中，群體內(nèi)基因多樣性(Hs=0.0753)在總基因多樣性(Ht=0.0771)中所占比例為97％。分子變異分析(AMOVA)結(jié)果，遺傳變異主要來(lái)自于種群內(nèi)(Fst=0.1210)。
　　 二、分析了6種林蛙30個(gè)樣本的線粒體16S rRNA基因序列，結(jié)合已經(jīng)發(fā)表的鎮(zhèn)

5、海林蛙和日本林蛙的同源序列，探討了環(huán)渤海地區(qū)林蛙群的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系和生物地理演化。用鄰接法(NJ)、最大簡(jiǎn)約法(MP)、最大似然法(ML)和貝葉斯推論(BI)構(gòu)建了系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)。以基于Hierarchical Likelihood Ratio Tests(hLRT)的GTR作為ML/BI法最佳進(jìn)化模型。得出以下研究結(jié)果和結(jié)論：
　　 (1)建立在系統(tǒng)發(fā)育基礎(chǔ)上，建議將黑龍江林蛙種組(費(fèi)梁等，2005)的桓仁林蛙劃歸中國(guó)林蛙種組。