浙江地區(qū)虎紋蛙線粒體控制區(qū)的遺傳多樣性研究.pdf

1、虎紋蛙(Hoplobatrachus Rugulosus)廣泛分布于我國的南方諸省,由于其個體大,肉味鮮美,營養(yǎng)豐富,是一種很好的食用蛙,因此多年來一直遭到過度捕捉,再加上生境的退化以及農(nóng)藥泛濫使用等因素的影響,虎紋蛙的野生資源急劇減少,有的地區(qū)應(yīng)經(jīng)難以見到虎紋蛙的蹤跡。目前虎紋蛙已經(jīng)被列為國家二級保護(hù)珍稀瀕危動物,IUCN和中國物種紅色名錄均將其列為易危種,并被列入了CITES附錄Ⅱ。浙江省雖然有著較為豐富的虎紋蛙資源,但是近年來數(shù)量

2、也在不斷地減少。本人對浙江省7個地區(qū)(昌化、臨安、湯溪、長山、永康、麗水和青田)虎紋蛙種群進(jìn)行遺傳學(xué)方面的研究,通過對線粒體基因的控制區(qū)部分序列進(jìn)行分析,以此得出有關(guān)浙江地區(qū)虎紋蛙遺傳多樣性和種群間親緣關(guān)系的結(jié)果,并為浙江地區(qū)虎紋蛙資源的保護(hù)和利用提供一定的理論依據(jù)。通過對69份虎紋蛙樣本進(jìn)行研究,得到了69條線粒體DNA控制區(qū)的部分序列,進(jìn)行分析后結(jié)果如下:
　　 1.所得序列的堿基A、T、C、G的平均含量分別為30.4％～3

3、1.9％(平均為31.1％)、28.9％30.7％(平均為30.0％)、27.1％～28.3％(平均為27.7％)、10.5％～11.4％(平均為11.2％)。其中AT含量比較豐富；
　　 2.經(jīng)過校對后得到的序列片段大小為332 bp,包含了保守位點292個,變異位點有40個,其中單一多態(tài)位點(Singleton variable sites)6個,簡約信息位點(Parsimonv informativesites)34個,占

4、整個序列長度的10.24％；
　　 3.得到的69條序列中包含了38種單倍型(Haplotypes),單倍型多樣性(Haplotypes diversity)為0.983,核苷酸多樣性(Nucleotide diversity)為0.02226,平均核苷酸差異數(shù)(Averagenumber of nucleotide differences)為7.390,這表明浙江地區(qū)的虎紋蛙具有較高的遺傳多樣性；
　　 4.使用Taj

5、ima’s方法進(jìn)行中性檢驗,Tajima’s D值為-0.36672(P>0.10),Fs值為-18.364(P>0.10),經(jīng)檢驗均不顯著(P>0.10),證明所有個體變異都符合選擇中性。這也說明了這個幾個地區(qū)的虎紋蛙種群大小保持穩(wěn)定；
　　 5.計算K值、Dxy值和Da值所反映的結(jié)果基本一致；
　　 6.通過MEGA4.1計算種群間的遺傳分化距離和DNASP4.10計算不同群體間的遺傳分化系數(shù),發(fā)現(xiàn)長山種群和湯溪種群

6、、昌化種群和臨安種群之間的親緣關(guān)系較近；
　　 7.通過UPGMA法、ME法和MP法進(jìn)行聚類分析,發(fā)現(xiàn)與SSR有關(guān)研究結(jié)果有一定的差異。
　　 基于以上結(jié)果和虎紋蛙養(yǎng)殖現(xiàn)狀,提出以下保護(hù)建議:
　　 1.保護(hù)虎紋蛙棲息地生境,并進(jìn)行就地保護(hù)和遷地保護(hù)；
　　 2.在選種時應(yīng)采用譜系選擇和個體表型選擇相結(jié)合的系群間雜交的方式來保持該品種的遺傳特質(zhì)和最大限度地保持群體的遺傳多樣性；
　　 3.應(yīng)盡快建