MyoD1基因與豬肉質(zhì)性狀相關性分析.pdf

1、肌分化基因(MyoD1)對豬的生長和肌肉的產(chǎn)生起著關鍵的作用,可使許多類型的細胞(如成纖維細胞、脂肪細胞等)轉(zhuǎn)化為成肌細胞并分化為成熟的肌纖維。目前在國內(nèi)還未見關于豬的MyoD1基因外顯子1的突變位點的報道,國外鮮有報道。分析MyoD1基因結(jié)構(gòu),研究該基因的變異,探討變異位點與豬肉質(zhì)性狀的關系,可為豬的肉質(zhì)改良提供分子基礎。
　　 隨機選擇140頭杜×長×大三元商品雜交豬屠宰。常規(guī)方法測定滴水損失、pH、肉色、大理石花紋、剪切力

2、、肌內(nèi)脂肪含量;運用Bioedit、BLAST、SMART、ProtParam、SOPMA等軟件和在線工具,對豬MyoD1基因進行生物信息學分析。采用PCR-SSCP技術分析MoyD1基因第1外顯子的單核苷酸多態(tài)性,一般線性模型分析基因型與豬肉質(zhì)性狀的關聯(lián)性。顯微鏡觀察肌肉石蠟切片并測定肌纖維的密度、直徑、面積、長徑、短徑和長短徑比,分析肌肉組織學特性與肉質(zhì)性狀的關系。
　　 所構(gòu)建不同物種的聚類圖顯示豬與牛羊的MyoD1基因結(jié)

3、構(gòu)最為相似:MyoD1基因存在較強的密碼子偏愛性;MyoD1蛋白由BASIC(堿性)結(jié)構(gòu)、HLH結(jié)構(gòu)域和Pfam:Myf5結(jié)構(gòu)域和由2個低復雜度區(qū)域(LCR)組成;該二級結(jié)構(gòu)主要由無規(guī)則卷曲和α螺旋構(gòu)成,在該蛋白上沒有發(fā)現(xiàn)合適的信號肽;磷酸化位點主要發(fā)生在Ser、Thr和Tyr上。在MyoD1基因5'UTR的119 bp處發(fā)現(xiàn)G＞A的突變,在其第1外顯子387 bp處發(fā)現(xiàn)C＞T突變,經(jīng)檢測這2個突變均為AA和AB基因型,2個變異位點在群

4、體中都是AA型為優(yōu)勢基因型,各位點基因頻率均符合Hardy-Weinberg平衡。在5'UTR上的突變對豬肌肉的肌內(nèi)脂肪含量和pH呈顯著影響(p＜0.05),而在第1外顯子上突變對本試驗所研究的肉質(zhì)性狀影響均不顯著(p＞0.05)。對肌纖維特性進行相關分析結(jié)果顯示,密度與剪切力和大理石花紋呈負相關(p＜0.05),直徑和短徑與大理石花紋呈正相關(p＜0.05)。
　　 結(jié)果表明,在MyoD1基因的5’UTR上的G＞A突變對豬肌肉