豬P311基因PCR-SSCPs及其與肉質(zhì)性狀關(guān)系的研究.pdf

1、神經(jīng)蛋白3.1(neuronal protein3.1，P311)又稱PTZ17，由定位于豬2號染色體的P311基因負(fù)責(zé)編碼，由Studler等于1993年首次發(fā)現(xiàn)于小鼠胚胎的腦組織中。研究表明P311蛋白廣泛存在于多種組織細(xì)胞中，且是一種細(xì)胞內(nèi)蛋白質(zhì)，主要存在于胞漿中，在細(xì)胞核內(nèi)亦有少量定位。P311基因mRNA序列中包含三個(gè)開放閱讀框(open reading frame，ORF)，但僅第一個(gè)開放閱讀框負(fù)責(zé)編碼蛋白質(zhì)。本實(shí)驗(yàn)室前期通

2、過抑制性消減雜交發(fā)現(xiàn)該基因在萊蕪豬及大白豬中的表達(dá)量差異顯著。本試驗(yàn)主要通過PCR-SSCP方法鑒定了54頭萊蕪豬和40頭魯萊黑豬該基因第一內(nèi)含子及3'側(cè)翼區(qū)共5處多態(tài)位點(diǎn)，并對各基因型個(gè)體的表達(dá)水平及另外4個(gè)相關(guān)基因SPARC、MYL1、ACADM、ACSL的表達(dá)水平進(jìn)行檢測。主要結(jié)果如下:
　　1、對94頭試驗(yàn)豬的肉質(zhì)測定數(shù)據(jù)進(jìn)行描述性統(tǒng)計(jì)分析及品種內(nèi)和總?cè)后w的肉質(zhì)數(shù)據(jù)間的相關(guān)性分析。萊蕪豬平均肌內(nèi)脂肪含量為8.96％，pH1

3、為6.54，pHμ為5.82，肉色評分為3.37，大理石紋評分為4.02，滴水損失為1.13％，失水率為19.91％，烹飪損失為17.60％，剪切值為36.02 N，魯萊黑豬上述肉質(zhì)性狀平均值分別為5.64％、6.44、5.64、3.04、3.31、2.88％、27.92％、26.22％、36.04 N。品種內(nèi)及總?cè)后w中均表現(xiàn)為IMF與pH1、大理石紋呈顯著的正相關(guān)關(guān)系而與肉色、嫩度的相關(guān)性不顯著，滴水損失、失水率、烹飪損失三者兩兩之間

4、均呈顯著相關(guān)。
　　2、5個(gè)多態(tài)位點(diǎn)SNP1F/1R位點(diǎn)、SNP2F/2R位點(diǎn)、SNP3F/3R位點(diǎn)、polyA1F/1R位點(diǎn)和polyA2F/2R位點(diǎn)中除SNP3F/3R位點(diǎn)僅檢測到兩種基因型以外，其余4個(gè)位點(diǎn)均檢測到三種基因型。5個(gè)位點(diǎn)處的各種基因型分別命名為SNP1F/1R位點(diǎn)處的AA型、BB型和AB型，SNP2F/2R位點(diǎn)處的CC型、DD型和CD型，SNP3F/3R位點(diǎn)處的EE型和EF型，polyA1F/1R位點(diǎn)處的MM型

5、、NN型和MN型，polyA2F/2R位點(diǎn)處的OO型、PP型和OP型。兩豬種在SNP2F/2R、SNP3 F/3R、polyA1F/1R位點(diǎn)處的優(yōu)勢等位基因相同，均為D、E、M基因。SNP2F/2R、polyA1F/1R和polyA2F/2R位點(diǎn)的多態(tài)分布在萊蕪豬和魯萊黑豬中均達(dá)到哈代-溫伯格平衡。
　　3、測序結(jié)果證明SNP1F/1R位點(diǎn)和SNP2F/2R位點(diǎn)的突變類型均為A/G突變，SNP3F/3R位點(diǎn)的突變類型為C/T突變，

6、上述三個(gè)突變位點(diǎn)分別為該基因的7636 bp、7976 bp、6207bp處。 polyA1F/1R和polyA2F/2R位點(diǎn)處的變異類型為缺失/插入突變，其中，polyA1F/1R位點(diǎn)處MM型和NN型的連續(xù)腺苷酸數(shù)目分別為18和15，polyA2F/2R位點(diǎn)處OO型和PP型的連續(xù)腺苷酸數(shù)目分別為15和12，MN型和OP型分別為兩polyA位點(diǎn)的雜合型。
　　4、萊蕪豬群體中SNP1F/1R多態(tài)位點(diǎn)處僅pHμ指標(biāo)在3種基因型之間存

7、在差異顯著性，表現(xiàn)為AB型的pHμ顯著高于AA型和BB型，而魯萊黑豬群體內(nèi)僅在肉色、剪切值兩指標(biāo)上檢測到差異顯著性，AA型的肉色顯著高于BB型，AA型的剪切值顯著高于AB型，其他情況下均差異不顯著。兩豬種中SNP2F/2R位點(diǎn)處3種基因型之間在9項(xiàng)肉質(zhì)指標(biāo)處均不存在差異顯著性。SNP3F/3R點(diǎn)處萊蕪豬群體中以EF型個(gè)體肉質(zhì)較好，而魯萊黑豬群體中以EE型個(gè)體肉質(zhì)較好。兩豬種polyA1 F/1R多態(tài)位點(diǎn)處的3種基因型之間在9項(xiàng)肉質(zhì)性狀上

8、均未表現(xiàn)出差異顯著性，但均表現(xiàn)為MN型個(gè)體的肉質(zhì)性狀普遍優(yōu)于其他兩純合型。萊蕪豬polyA2F/2R多態(tài)位點(diǎn)處三種基因型的肉質(zhì)性狀無差異顯著性，而魯萊黑豬中3種基因型之間在失水率和烹飪損失指標(biāo)上表現(xiàn)出差異顯著性，且PP型個(gè)體的失水率顯著高于OP型個(gè)體，OO型和PP型個(gè)體的烹飪損失顯著高于OP型。
　　5、萊蕪豬與魯萊黑豬群體內(nèi)SNP1F/1R位點(diǎn)處3種基因型個(gè)體的SPARC、MYL1、P311基因的表達(dá)水平差異均不顯著，ACADM

9、、ACSL兩基因的表達(dá)水平僅在萊蕪豬群體內(nèi)差異顯著，表現(xiàn)為BB型個(gè)體的表達(dá)水平顯著高于AA型和AB型，后兩者之間差異不顯著。兩豬種中SNP2F/2R位點(diǎn)處各基因型上述5個(gè)基因的表達(dá)量均差異不顯著。萊蕪豬群體內(nèi)SNP3F/3R位點(diǎn)處5個(gè)基因的表達(dá)水平均表現(xiàn)為EE＜EF，魯萊黑豬群體中除P311基因外其他4個(gè)基因也呈現(xiàn)這種趨勢。萊蕪豬群體中polyA1F/1R位點(diǎn)處5個(gè)基因的表達(dá)水平在3種基因型之間差異均不顯著，而在魯萊黑豬群體中MYL1基