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1、同濟(jì)大學(xué)碩士學(xué)位論文蛋白質(zhì)質(zhì)譜數(shù)據(jù)處理方法的研究姓名:舒晨申請(qǐng)學(xué)位級(jí)別:碩士專業(yè):分析化學(xué)指導(dǎo)教師:李通化20090601ABSTRACTABSTRACTWiththesequencingofthehumangenomecompleted1ifesciencehasenteredapostgenomeperiodProteomicsisoneoftheimportantareasofthepost—genomeresearchInthe
2、researchofproteomicsproteinidentificationisthemostcriticallinkWiththerapiddevelopmentofmassspectrometrywecangetmassivemassspectrometrydatainashorttimebuthowtoextractusefulinformationfromthemassivedataandmakeeffectiveiden
3、tificationofproteinisamajordifficultyinproteomicsresearchByvirtueofthecharacteristicsoffastandaccurate,theidentificationmethodbasedontandemmassspectrometryandproteinsequencedatabasesearchhasbecomeamajormeansofproteiniden
4、tificationInthispaperwehavethoroughlystudiedcommonlyusedalgorithmforproteinidentificationint11einternationalareathenuseandimprovetherelativeentropyscoringalgorithmtodesignanddevelopmentOurownproteinidentificationsystemwi
5、thCjf|languageThesystemhasthreemoduleswithdifferentfunctionWbusePIsoftwaretofindmassspectrometrydataoftheoreticalsimulationfragmentationandextractthecorrespondingproteinandpeptideinformationTheninputtheexperimentalmasssp
6、ectrometrydatafilesofspecificformattohandleScore廿1esimilaritybetweenexperimentaldataandtheoreticaldata,andgivethefinalidentificationresultInordertoverifytheeffectivenessoftheproteinidentificationsystem,weusemultigroupthe
7、oreticaltandemmassspectrometrydatatotestthesystemandanalyzetheimpactofscoringresultbychangingmasstochargeratiovalue,relativeintensityvalueandmissingspectrumAswellwecarryouttoidentifywiⅡlBSAstandardproteinexperimentaldata
8、setandcomparetheresultwiththeonebyMascotsoftwareWbfindthatOursystemhaveidentified8piecesofmeaningfulproteinFinallywetestthesystemwithl8proteinexperimentaldatasetandprovethatOursystemhasarelativelygoodresultfortheidentifi
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