兩種家豬心臟組織表達(dá)序列標(biāo)簽的分析.pdf

1、ESTs(Expressed Sequence Tags)是從已建好的cDNA文庫(kù)中隨機(jī)挑取克隆,從5'末端或3'末端對(duì)插入的cDNA片段進(jìn)行一輪單向自動(dòng)測(cè)序,所獲得的約60-500bp的一段cDNA序列.在哺乳動(dòng)物中,基因組序列的大部分都是不表達(dá)的序列,而ESTs測(cè)序可以快速的得到表達(dá)基因的部分序列.因此,通過ESTs測(cè)序可以高效率高通量的進(jìn)行基因識(shí)別,如在同一物種中搜尋基因家族的新成員,在不同物種間搜尋功能相同的基因,搜尋已知基因的

2、不同剪接模式,及基因預(yù)測(cè)、基因圖譜的繪制.此外,大規(guī)模ESTs測(cè)序還可以提供特定組織或發(fā)育階段基因表達(dá)的數(shù)量信息,通過對(duì)不同組織或發(fā)育階段基因表達(dá)數(shù)量差異的分析,有助于加深人們對(duì)基因功能、基因間相互關(guān)系的認(rèn)識(shí).該研究選取丹麥成年長(zhǎng)白母豬的心臟、肌肉、主動(dòng)脈、左心室和中國(guó)成年二花臉母豬心臟共5個(gè)組織,建立相應(yīng)的cDNA文庫(kù),在此基礎(chǔ)之上測(cè)定了35180條表達(dá)序列標(biāo)簽.通過比較分析長(zhǎng)白豬4種組織的基因表達(dá)譜,找出了長(zhǎng)白豬心臟組織中3個(gè)顯著高