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1、miR513ClusterByZhenghuaSunADissertationSubmittedtoGraduateUniversityofChineseAcademyofSciencesInpartialfulfillmentoftherequirementForthedegreeofDoctorofScienceKunmingInstituteofZoologyTheChineseAcademyofSciences,Kunming,
2、Yunnan,ChinaMay2012中文摘要恒河猴胚胎干細(xì)胞mioroRNA表達(dá)譜和靈長(zhǎng)類快速進(jìn)化的miR513家族的功能分化研究中文摘要MicroRNA(miRNA)是一類廣泛存在于動(dòng)植物基因組中的非編碼小RNA。通過與基因3’UTR區(qū)的互補(bǔ)結(jié)合介導(dǎo)其降解或者抑制翻譯,從而在轉(zhuǎn)錄后水平發(fā)揮重要的調(diào)控作用,幾乎影響著生命過程的各個(gè)方面,例如胚胎發(fā)育、細(xì)胞分化和腫瘤發(fā)生等。研究表明miRNA在小鼠和人的胚胎干細(xì)胞自我更新和分化過程中也起
3、著重要作用,然而恒河猴(RhesusmacocQ)胚胎干細(xì)胞的miRNA表達(dá)調(diào)控模式之前還沒有報(bào)道。本論文通過高通量測(cè)序技術(shù)首次揭示了恒河猴胚胎干細(xì)胞miRNA的表達(dá)模式,并發(fā)現(xiàn)了新的miRNA分子,為研究miRNA在恒河猴胚胎干細(xì)胞中的作用提供了基礎(chǔ)數(shù)據(jù)。研究結(jié)果顯示,三株恒河猴胚胎干細(xì)胞系共享924%的miRNA分子。通過四種檢驗(yàn)方法對(duì)miRNA基因簇和總體miRNA水平的比較均證實(shí)三株胚胎干細(xì)胞miRNA的表達(dá)模式是高度一致的。在
4、miRNA靶基因預(yù)測(cè)及功能注釋中,MAPK、Wnt、TGFp等對(duì)胚胎干細(xì)胞維持干細(xì)胞特性及分化十分重要的信號(hào)通路受到miRNA的顯著調(diào)控。這進(jìn)一步提示了miRNA在恒河猴胚胎干細(xì)胞的自我更新和分化過程中起到重要的調(diào)控作用。對(duì)miRNA與靶基因作用網(wǎng)絡(luò)的分析表明:靶基因受miRNA調(diào)控的程度與其進(jìn)化速率呈負(fù)相關(guān)。通過與現(xiàn)有人和小鼠胚胎于細(xì)胞的miRNA表達(dá)譜數(shù)據(jù)的比較,我們發(fā)現(xiàn)大多數(shù)miRNA在不同物種間的表達(dá)情況比較保守,這也印證了功能
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