基于SSR和AFLP標(biāo)記的東方百合群體遺傳圖譜構(gòu)建及QTL定位.pdf

1、百合屬植物是單子葉植物綱百合科的多年生球根花卉，其在全世界范圍內(nèi)分布約有100種（變種），是植物中基因組最大的類(lèi)群之一。東方百合(Oriental Hybrid lily)是百合中一個(gè)重要的雜種系，不同的百合雜種系群體得到構(gòu)建，如AA（亞洲系百合×亞洲系百合），AL（亞洲系百合×鐵炮百合），OT（東方系百合×喇叭百合）等。在本實(shí)驗(yàn)室構(gòu)建了OO（東方百合×東方百合）作圖群體,
　　利用將SSR和AFLP兩種分子標(biāo)記法構(gòu)建了百合連鎖群

2、。其中，利用本實(shí)驗(yàn)室開(kāi)發(fā)的495對(duì)SSR引物對(duì)群體進(jìn)行檢測(cè)。試驗(yàn)中最終用于構(gòu)建連鎖圖譜的F1群體為100個(gè)單株。利用JoinMap4軟件的CP模型對(duì)獲得的分子標(biāo)記數(shù)據(jù)進(jìn)行處理分析，構(gòu)建了30個(gè)遺傳連鎖群圖譜，其中?Sorbonne’（母本）和?Gaudi’（父本）各為12個(gè)，F(xiàn)1代為6個(gè)。分析觀賞和農(nóng)藝性狀后，用MapQTL4.0軟件定位遺傳連鎖圖譜中的QTL。主要的研究結(jié)果總結(jié)如下:
　　1.試驗(yàn)對(duì)940對(duì)引物組進(jìn)行了篩選，篩選

3、出172對(duì)合適的引物組合（包括96個(gè)個(gè)AFLP標(biāo)記和76個(gè)SSR標(biāo)記引物）用于構(gòu)建圖譜。最終共標(biāo)記出616個(gè)位點(diǎn)，其中AFLP標(biāo)記出465個(gè)位點(diǎn)，SSR標(biāo)記出151個(gè)位點(diǎn)。最終獲得616個(gè)多態(tài)性位點(diǎn)，其中AFLP位點(diǎn)465個(gè)，SSR位點(diǎn)151個(gè)。為了對(duì)標(biāo)記進(jìn)行分組，對(duì)連鎖值（LOD）進(jìn)行了2到10的梯度設(shè)置。在分組后，利用 LOD為3.0-5.0構(gòu)建了連鎖圖譜。整個(gè)圖譜的長(zhǎng)度為2144.2cM.在遺傳圖譜中共顯示189個(gè)標(biāo)記位點(diǎn)，其中A

4、FLP位點(diǎn)142個(gè)，SSR位點(diǎn)47個(gè)。
　　2.母系為12個(gè)連鎖群，全長(zhǎng)為851.6cM。父本最小和最大的連鎖群的遺傳距離分別為2.2cM和55.7cM。父本遺傳連鎖圖譜共有52個(gè)標(biāo)記位點(diǎn)，其中AFLP位點(diǎn)42個(gè)，SSR位點(diǎn)10個(gè)。在12個(gè)連鎖群的父本遺傳圖譜中，連鎖群全長(zhǎng)為676 cM，標(biāo)記位51個(gè)。結(jié)果表明，全長(zhǎng)中AFLP標(biāo)記位點(diǎn)46個(gè)，SSR標(biāo)記位點(diǎn)5個(gè)。在母系圖譜中的最小連鎖群距離為0.1 cM，而最大距離為47.7 cM

5、。在F1代的6個(gè)連鎖群中發(fā)現(xiàn)有86完全評(píng)估位點(diǎn)。結(jié)果還表明，AFLP標(biāo)記數(shù)得分位點(diǎn)為54位點(diǎn)，SSR標(biāo)記位點(diǎn)有32個(gè)。F1代的連鎖群總長(zhǎng)度為606.6 cM。F1代最小和最大的連鎖群的距離分別為0.2 cM和26.8 cM。
　　3.檢測(cè)到控制重要百合性狀的8個(gè)QTL位點(diǎn)，每一個(gè)QTL位點(diǎn)可解釋表型變異的2.4％~89.5%。在LG-F1P2上，LOD LOD的最高值的最高值（35.21）下找到了4個(gè)QTL。母系的LG-M10上的

6、兩個(gè)標(biāo)記位點(diǎn)間定位到一個(gè)有關(guān)葉數(shù)的QTL，其LOD值為7.08。以E-CGC/M-CGC-4為引物，將花被片長(zhǎng)度的QTL定位在F1雜交圖譜的LG-F1P2上?；ū黄瑢挾鹊腝TL與LN相似，定位在母系的LG-M10上。PW2的QTL在父本的LG-F4。在F1、母本和父本圖譜上定位有5個(gè)關(guān)于斑點(diǎn)數(shù)量的QTL，1個(gè)長(zhǎng)度為51cM關(guān)于斑點(diǎn)大小的QTL在母系的LG-M8上，以E-CGC/M-CGC-4為引物在F1的LG-F1P2上定位到株高的QT