基于SSR和AFLP標記的東方百合群體遺傳圖譜構(gòu)建及QTL定位.pdf

1、百合屬植物是單子葉植物綱百合科的多年生球根花卉，其在全世界范圍內(nèi)分布約有100種（變種），是植物中基因組最大的類群之一。東方百合(Oriental Hybrid lily)是百合中一個重要的雜種系，不同的百合雜種系群體得到構(gòu)建，如AA（亞洲系百合×亞洲系百合），AL（亞洲系百合×鐵炮百合），OT（東方系百合×喇叭百合）等。在本實驗室構(gòu)建了OO（東方百合×東方百合）作圖群體,
　　利用將SSR和AFLP兩種分子標記法構(gòu)建了百合連鎖群

2、。其中，利用本實驗室開發(fā)的495對SSR引物對群體進行檢測。試驗中最終用于構(gòu)建連鎖圖譜的F1群體為100個單株。利用JoinMap4軟件的CP模型對獲得的分子標記數(shù)據(jù)進行處理分析，構(gòu)建了30個遺傳連鎖群圖譜，其中?Sorbonne’（母本）和?Gaudi’（父本）各為12個，F(xiàn)1代為6個。分析觀賞和農(nóng)藝性狀后，用MapQTL4.0軟件定位遺傳連鎖圖譜中的QTL。主要的研究結(jié)果總結(jié)如下:
　　1.試驗對940對引物組進行了篩選，篩選

3、出172對合適的引物組合（包括96個個AFLP標記和76個SSR標記引物）用于構(gòu)建圖譜。最終共標記出616個位點，其中AFLP標記出465個位點，SSR標記出151個位點。最終獲得616個多態(tài)性位點，其中AFLP位點465個，SSR位點151個。為了對標記進行分組，對連鎖值（LOD）進行了2到10的梯度設置。在分組后，利用 LOD為3.0-5.0構(gòu)建了連鎖圖譜。整個圖譜的長度為2144.2cM.在遺傳圖譜中共顯示189個標記位點，其中A

4、FLP位點142個，SSR位點47個。
　　2.母系為12個連鎖群，全長為851.6cM。父本最小和最大的連鎖群的遺傳距離分別為2.2cM和55.7cM。父本遺傳連鎖圖譜共有52個標記位點，其中AFLP位點42個，SSR位點10個。在12個連鎖群的父本遺傳圖譜中，連鎖群全長為676 cM，標記位51個。結(jié)果表明，全長中AFLP標記位點46個，SSR標記位點5個。在母系圖譜中的最小連鎖群距離為0.1 cM，而最大距離為47.7 cM

5、。在F1代的6個連鎖群中發(fā)現(xiàn)有86完全評估位點。結(jié)果還表明，AFLP標記數(shù)得分位點為54位點，SSR標記位點有32個。F1代的連鎖群總長度為606.6 cM。F1代最小和最大的連鎖群的距離分別為0.2 cM和26.8 cM。
　　3.檢測到控制重要百合性狀的8個QTL位點，每一個QTL位點可解釋表型變異的2.4％~89.5%。在LG-F1P2上，LOD LOD的最高值的最高值（35.21）下找到了4個QTL。母系的LG-M10上的

6、兩個標記位點間定位到一個有關葉數(shù)的QTL，其LOD值為7.08。以E-CGC/M-CGC-4為引物，將花被片長度的QTL定位在F1雜交圖譜的LG-F1P2上。花被片寬度的QTL與LN相似，定位在母系的LG-M10上。PW2的QTL在父本的LG-F4。在F1、母本和父本圖譜上定位有5個關于斑點數(shù)量的QTL，1個長度為51cM關于斑點大小的QTL在母系的LG-M8上，以E-CGC/M-CGC-4為引物在F1的LG-F1P2上定位到株高的QT