基于基因表達(dá)譜芯片確定前列腺癌致病有關(guān)基因及其功能.pdf

1、山東大學(xué)博士學(xué)位論文基于基因表達(dá)譜芯片確定前列腺癌致病有關(guān)基因及其功能姓名：王建明申請(qǐng)學(xué)位級(jí)別：博士專業(yè)：臨床醫(yī)學(xué)指導(dǎo)教師：史本康20121016山東大學(xué)博士學(xué)位論文由前列腺癌引起的其他疾病。這是由于前列腺癌在很多病例中(約占三分之二)呈現(xiàn)緩慢增殖，并且無(wú)癥狀。另一方面，大約三分之一的前列腺癌具有侵襲性，發(fā)展迅速的特點(diǎn)，該種類型的前列腺癌是除肺癌以外的第二大致死癌癥。因此，前列腺癌的發(fā)生發(fā)展過(guò)程中的差異基因的鑒定對(duì)于早期診斷和及時(shí)治療前

2、列腺癌具有重要意義。目前，PSA(prostatespecificantigen，前列腺特異抗原)是用于前列腺癌診斷的重要標(biāo)志物。PSA具有組織特異性，只存在于人前列腺腺泡及導(dǎo)管上皮細(xì)胞胞漿中，在人的其它細(xì)胞中不表達(dá)。但是，PSA并沒有腫瘤特異性，良性前列腺增生和前列腺炎也會(huì)出現(xiàn)PSA陽(yáng)性的結(jié)果。而且，用基因治療的手段治療前列腺癌時(shí)，需要在與正常前列腺組織相比，前列腺癌組織中發(fā)生差異表達(dá)的基因中篩選有效的合適的靶分子?；蛐酒夹g(shù)的產(chǎn)生

3、使人們可以一次性檢測(cè)上萬(wàn)個(gè)基因的表達(dá)譜，面對(duì)如此海量的數(shù)據(jù)，傳統(tǒng)的單個(gè)基因的分析研究方法已經(jīng)不適用。基因芯片數(shù)據(jù)分析是對(duì)從基因芯片高密度雜交點(diǎn)陣圖中提取的雜交點(diǎn)熒光強(qiáng)度信號(hào)進(jìn)行的定性和定量的分析，通過(guò)有效數(shù)據(jù)篩選、相關(guān)基因聚類等方法，最終將海量的芯片數(shù)據(jù)整合，發(fā)現(xiàn)基因表達(dá)譜與生物學(xué)功能之間可能存在的聯(lián)系?；蛐酒磉_(dá)譜數(shù)據(jù)分析將無(wú)機(jī)的信息數(shù)據(jù)有有機(jī)的生命活動(dòng)聯(lián)系起來(lái)，解釋基因的功能，疾病的分子機(jī)理，是生物信息學(xué)研究的重要課題。基因芯片技

4、術(shù)能夠同時(shí)、快速、準(zhǔn)確地分析數(shù)以千計(jì)基因組信息，給研究者研究基因表達(dá)譜提供了很大的便利，極大的減輕了大規(guī)模的篩選前列腺癌差異表達(dá)基因的工作量。目前，該技術(shù)已經(jīng)廣泛的應(yīng)用于多種癌癥基因表達(dá)譜分析、尋找疾病特異基因等方面研究中?！灸康摹勘狙芯坷没蛐酒瑪?shù)據(jù)分析軟件包bioconductor對(duì)來(lái)自基因表達(dá)數(shù)據(jù)庫(kù)GeneExpressionOmnibus(GEO)的19個(gè)前列腺癌基因表達(dá)譜芯片數(shù)據(jù)(良性前列腺組織，原發(fā)性前列腺癌，轉(zhuǎn)移性前列腺