亞洲香菇系統(tǒng)發(fā)育學地位的重新評估與遺傳多樣性分析.pdf

1、華中農業(yè)大學博士學位論文亞洲香菇系統(tǒng)發(fā)育學地位的重新評估與遺傳多樣性分析姓名：徐學鋒申請學位級別：博士專業(yè)：微生物學指導教師：林芳燦20050701個形念種，而譜系v卻與澳洲群體的系統(tǒng)發(fā)育關系更近，這也剛好與“東半球的三個形態(tài)學種相互交配可親和”的結論吻合表明分子系統(tǒng)學與傳統(tǒng)形態(tài)分類之間可以相互佐證；亞洲群體中譜系V的特殊性預示著可以將其另立為一個新種，是否可行尚待深入研究5多樣性中心的確立：在全球Lentinula屬的7個(或者說8個

2、)譜系中，中國既擁有菌株數(shù)量眾多的島嶼一大陸型譜系I，還擁有惟一的大陸型譜系v，而且譜系I還有進一步分化成兩個譜系的趨勢無論是從譜系的數(shù)量，譜系的類型還是菌株的分布范圍上考慮，中國(或者說是亞洲)都是Lentinula屆重要的遺傳多樣性中心，對形態(tài)學種厶edodes而言，就更是如此6。分子鐘檢驗和分歧時間的估計：從7個(或者說8個)不同的譜系中分別抽取部分代表菌株，以金錢菌為外類群構建系統(tǒng)樹，以似然比法檢驗分子鐘，發(fā)現(xiàn)11rs不具各進化

3、速率一致性，拒絕分子鐘假說但是仍舊以它估計支長，結合前人的研究結果校正分歧時間，發(fā)現(xiàn)亞洲主流譜系l與其它譜系的分歧(節(jié)點D)發(fā)生在420萬年左右；譜系1分化成h和Ib的時間大約在39萬年左右；以美洲與歐亞大陸分離的時間和新西蘭與澳洲分離的時間作為校正點，粗略估計幾個重要節(jié)點的分歧時間有較大差異()群體遺傳分析：1以亞洲群體為主的東半球Lentinula屬不同聚群的劃分及多樣性區(qū)域的確立t由于亞洲菌株都界定為形態(tài)學種Lentinulaed

4、odes，以前述系統(tǒng)發(fā)育分析方法構建亞洲范圍內的系統(tǒng)發(fā)育關系，將亞洲群體確立為3個不同的譜系，根據(jù)不同地域菌株在不同譜系中的分布可以將亞洲菌株分成東北亞、西北高原、西南高原、東部沿海和泛中南等5個群體結合巴新和澳洲及新西蘭的2個群體進行綜合分析發(fā)現(xiàn)，‘中國西北高原、西南高原、東部沿海和巴一澳等4個群體涵蓋的譜系數(shù)多，遺傳多樣性相對更為豐富，其中中國西南最為突出2。群體遺傳格局：對5個亞洲群體和2個澳洲群體進行綜合分析，發(fā)現(xiàn)中國西南群體的

5、核苷酸多樣度最高，其次為巴一澳，西北和泛中南等3個群體，東部沿海群體最低群體問的關系顯示t西南群體與東北、東部沿海、泛中南和西北等4個群體的遺傳分化相當，遺傳距離接近；西北群體與西南群體的關系相對密切，與巴一澳和新西蘭群體的關系緊密程度較次于西南，而與東北、東部沿海和泛中南的關系則相對更遠一些；巴一澳和新西蘭群體與東北，東部沿海和泛中南等群體的關系最遠；需要關注的是巴一澳和新西蘭群體與中國西北群體的關系相對更為密切，但地緣關系卻很遠3演