中國(guó)近海兩種鯛科魚(yú)類遺傳結(jié)構(gòu)及遺傳多樣性分析.pdf

1、為了研究黃鰭鯛群體遺傳結(jié)構(gòu)和遺傳多樣性狀況，利用PCR技術(shù)和直接測(cè)序的方法，測(cè)定了中國(guó)三個(gè)黃鰭鯛地理群體（廣東深圳市、福建廈門(mén)市和廣西北海市）共100個(gè)個(gè)體的線粒體DNA（mtDNA）D-loop控制區(qū)序列，另外，還從GeneBank中下載了22條黃鰭鯛D-loop序列，通過(guò)排列得到了427bp序列，通過(guò)研究發(fā)現(xiàn)，這些黃鰭鯛群體存在著豐富的DNA序列多態(tài)性，共檢測(cè)到106個(gè)多態(tài)性位點(diǎn)（24.82％），有10個(gè)插入缺失位點(diǎn)，轉(zhuǎn)換大于顛換。

2、122個(gè)個(gè)體有108個(gè)單倍型，單倍型多樣度范圍為0.9929～0.9952，核苷酸多樣度范圍為0.0125～0.0187。通過(guò)Nei's遺傳距離構(gòu)建的分子聚類關(guān)系樹(shù)中可看出，北海群體單獨(dú)構(gòu)成一支，而廈門(mén)群體和深圳群體構(gòu)成另外一支；通過(guò)對(duì)三個(gè)地理群體進(jìn)行的分子方差分析（AMOVA），從得出的F<,st>值和p值發(fā)現(xiàn)北海群體與其他兩個(gè)群體間（廈門(mén)群體和深圳群體）存在顯著性差異（BH和XM：F<,st>=0.5483p<0.001；BH和SZ

3、：F<,st>=0.5609p<0.001），而廈門(mén)群體和深圳群體間的差異并不顯著（F<,st>＝-0.0023，p>0.05），通過(guò)Wright公式N<,m>＝（1／Fst-1）／2計(jì)算出這三個(gè)群體間的N<,m>值，可以看出廈門(mén)群體和深圳群體間存在有廣泛的基因交流（N<,m>＝204.09），而北海群體與其他兩個(gè)群體間的基因交流卻很有限（N<,m>值SZ＝0.3914，XM＝0.4119）?；诒狙芯康慕Y(jié)果認(rèn)為，中國(guó)近海三個(gè)黃鰭鯛地理

4、群體應(yīng)為兩個(gè)地理種群，北海群體為一單獨(dú)種群，而廈門(mén)和深圳群體為另一種群。 利用PCR技術(shù)擴(kuò)增了中國(guó)近海6個(gè)地理群體（福建省廈門(mén)市、福建省泉州市、浙江舟山市、廣東深圳市、廣西北海市和海南三亞市）215個(gè)二長(zhǎng)棘鯛個(gè)體線粒體D-loop序列，得到了536bp片斷。結(jié)果發(fā)現(xiàn)，6個(gè)地理群體內(nèi)和群體間都存在著豐富的DNA序列多態(tài)性，共檢測(cè)到91個(gè)多態(tài)性核苷酸位點(diǎn)（16.98％），插入缺失位點(diǎn)僅有5個(gè)，轉(zhuǎn)換大于顛換。215個(gè)個(gè)體共得到了191

5、個(gè)單倍型，其中共享單倍型24個(gè)。通過(guò)Arlequin2.0軟件計(jì)算了這6個(gè)地理群體的單倍型多樣性指數(shù)（h＝0.9764～1.0000）和核苷酸多樣性指數(shù)（p＝0.0120～0.0144）。根據(jù)群體間Nei's遺傳距離用UPGMA法構(gòu)建的中國(guó)近海6個(gè)二長(zhǎng)棘鯛群體的分子聚類關(guān)系樹(shù)和以及對(duì)群體進(jìn)行分子方差分析（AMOVA），可以看出，變異主要發(fā)生在群體間的個(gè)體內(nèi)（99.84％），僅有很少變異發(fā)生在群體間（0.16％），這6個(gè)地理群體間并不存在