貴州6個(gè)地方水牛群體的遺傳多樣性及親緣關(guān)系研究.pdf

1、根據(jù)聯(lián)合國(guó)糧農(nóng)組織(FAO)推薦以及從文獻(xiàn)中查找得到22對(duì)普通牛微衛(wèi)星引物，通過(guò)試驗(yàn)篩選從中獲得能用于沼澤型水牛研究的11對(duì)引物(HEL13、BM1225、BM1818、BM2113、EHT11、ETH10、ETH225、CSSRM60、CSSM66、INRA026、ILSTS005)，用以對(duì)6個(gè)貴州地方水牛群體進(jìn)行微衛(wèi)星多態(tài)性檢測(cè)，從分子水平上提供了貴州地方水牛遺傳多樣性及親緣關(guān)系的根據(jù)。得到主要結(jié)果如下： 1、通過(guò)篩選，得到

2、可用于沼澤型水牛進(jìn)行微衛(wèi)星分析的11對(duì)引物，確定了其相應(yīng)的PCR反應(yīng)條件，并獲得貴州地方水牛核基因組的多態(tài)性擴(kuò)增結(jié)果。 2、從6個(gè)貴州地方水牛群體的11個(gè)微衛(wèi)星座位上共檢測(cè)到72個(gè)等位基因，其中共享等位基因49個(gè)，非共享等位基因23。各等位基因頻率介于0.0094～0.5236。 3、6個(gè)群體在11個(gè)微衛(wèi)星座位上的多態(tài)座位百分比均達(dá)100％，其觀察雜合度、期望雜合度、Nei氏期望雜合度分別為0.9278±0.2113、0

3、.7979±0.0297、0.7967±0.0296，平均雜合度為0.7612±0.0313。 4、本研究得到的平均有效等位基因數(shù)為4.2±0.9513個(gè)，平均多態(tài)信息含量(PIC)為0.7196±0.0417，為高度多態(tài)，說(shuō)明貴州地方水牛遺傳多樣性十分豐富。 5、本研究得到的Nei氏標(biāo)準(zhǔn)遺傳距離介于0.0965～0.3080，群體間遺傳距離最遠(yuǎn)的是畢節(jié)水牛與黔南水牛，最近的是黔東南水牛與黔南水牛。遺傳相似系數(shù)則介于0.

4、7346～0.9050。 6、根據(jù)逐步突變模型，假定水牛微衛(wèi)星平均每代突變率為4×10-3，水牛世代間隔為6年，計(jì)算出貴州地方水牛的遺傳分化時(shí)間在290年～925年。 7、綜合對(duì)比UPMGA法和NJ法，對(duì)貴州地方水牛的6個(gè)群體進(jìn)行了聚類(lèi)分析，并結(jié)合對(duì)貴州水牛的傳統(tǒng)劃分，提出了對(duì)貴州水牛按“三類(lèi)型式”和“四類(lèi)型式”共四種劃分法的劃分體系，而以劃分為“黔北水牛、黔中水牛、黔南水牛、畢節(jié)水牛”以及劃分為“黔北水牛、黔中水牛、黔