肺動(dòng)脈閉鎖遺傳學(xué)初步研究.pdf_第1頁(yè)
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文檔簡(jiǎn)介

1、第一部分肺動(dòng)脈閉鎖染色體核型分析
  【目的】對(duì)肺動(dòng)脈閉鎖患兒進(jìn)行核型檢測(cè),分析染色體異常與肺動(dòng)脈閉鎖的關(guān)系。
  【方法】35例肺動(dòng)脈閉鎖患兒行G顯帶常染色體檢測(cè)。
  【結(jié)果】發(fā)現(xiàn)1例合并有21三體綜合征,余染色體核型正常。
  【結(jié)論】21三體綜合征可合并有肺動(dòng)脈閉鎖,肺動(dòng)脈閉鎖患兒染色體核型異常并不多見,提示應(yīng)用常規(guī)染色體核型分析無(wú)法對(duì)這種嚴(yán)重復(fù)雜的先心病進(jìn)行篩查。
  第二部分肺動(dòng)脈閉鎖TBX1微

2、缺失研究
  【目的】對(duì)肺動(dòng)脈閉鎖患兒進(jìn)行TBX1微缺失檢測(cè),探討肺動(dòng)脈閉鎖與TBX1的關(guān)系。
  【方法】選用荷蘭Kreatech公司PoseidonFISHDNA的KBI-40104MDDiGeorgeT-box1(22q11)/22q13(SHANK3),應(yīng)用染色體原位熒光雜交技術(shù)(FISH)對(duì)染色體核型正常的34例肺動(dòng)脈閉鎖患兒進(jìn)行TBX1微缺失檢測(cè)。
  【結(jié)果】發(fā)現(xiàn)3例TBX1微缺失陽(yáng)性患兒,陽(yáng)性率為8.8

3、2%。
  【結(jié)論】TBX1是22q11.2微缺失的核心基因,22q11.2微缺失是肺動(dòng)脈閉鎖的主要致病原因之一,TBX1可能是肺動(dòng)脈閉鎖易感基因。
  第三部分全外顯子測(cè)序初步篩選右室流出道梗阻易感基因
  【目的】對(duì)一個(gè)右室流出道梗阻家系中2名成員進(jìn)行全外顯子測(cè)序,進(jìn)行數(shù)據(jù)分析,初步篩選右室流出道梗阻易感基因。
  【方法】收集一個(gè)右室流出道梗阻家系中2名成員的靜脈血,采用lifetechnology全外顯子

4、捕獲試劑盒進(jìn)行捕獲,用Lifetechnologysolid5500xl高通量測(cè)序儀進(jìn)行高通量測(cè)序,測(cè)序結(jié)果與公共遺傳突變數(shù)據(jù)庫(kù)(db132SNP)及華中科技大學(xué)人類基因組中心正常人外顯子數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行比對(duì),過(guò)濾已報(bào)道的常見變異,再將單核苷酸非同義突變進(jìn)行整合,初步篩選出候選基因。
  【結(jié)果】結(jié)果顯示過(guò)濾后落在外顯子區(qū)域的單核苷酸變異(SNP)數(shù)目外婆為42727個(gè),孫子為38207個(gè);過(guò)濾后落在外顯子區(qū)域未報(bào)道的單核苷酸變異數(shù)目外

5、婆為4582個(gè),孫子為4249個(gè);通過(guò)ACCESS數(shù)據(jù)分析發(fā)現(xiàn),有121個(gè)新發(fā)現(xiàn)單核苷酸變異同時(shí)存在于祖孫兩人的基因組中。同時(shí)使用華中科技大學(xué)人類基因組中心已有正常人外顯子對(duì)照數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行篩選,46個(gè)變異沒(méi)有在對(duì)照數(shù)據(jù)庫(kù)中發(fā)現(xiàn)。將46個(gè)變異輸入到使用ANNOVAR軟件預(yù)測(cè)可能有害的突變位點(diǎn),將候選基因范圍縮小到19個(gè)。
  【結(jié)論】WNK1、KRTAP1-1、UBR2、EPS15、CKAP2、PIGB、DENND4A、HYDIN、C

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